Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  343  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
113927879--113927924
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23
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2.0
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2.0
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205
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2.2
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0
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2.0
20
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58
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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20
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18
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10
0
44
46
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134
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0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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2.7
25
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20
1
1
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11
71
20
1
1
76
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24
17
28
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10
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1.63
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47
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193
24
17
28
28
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20
1.9
20
100
0
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0
34
1.19
114094808--114094864
21
2.5
22
80
11
62
66
10
7
15
1.42
114104534--114104804
131
2.1
131
87
1
382
34
16
18
29
1.93
114108381--114108426
14
3.1
16
78
15
53
15
4
15
65
1.43
114113935--114114048
10
11.2
10
67
17
56
59
4
1
34
1.27
114114283--114114322
19
2.2
18
86
4
53
25
0
2
72
0.97
114115477--114115517
15
2.6
16
92
7
66
17
0
21
60
1.35
114115508--114115674
6
28.7
6
71
6
101
20
5
14
58
1.57
114115537--114115582
17
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17
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21
2
13
63
1.40
114115860--114115903
16
2.8
16
89
0
61
15
15
15
52
1.75
114123360--114123427
29
2.6
25
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27
5
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50
1.68
114123366--114123425
29
2.1
28
87
6
86
25
5
16
53
1.63
114124093--114124154
21
3.0
21
80
4
72
33
32
16
17
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0
124
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29
1.96
114133671--114133713
22
1.9
23
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4
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4
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23
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0
0
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0.77
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13
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13
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34
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26
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27
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2.0
21
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0
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21
29
19
1.98
114161510--114161556
22
2.0
24
92
8
80
34
0
6
59
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114165797--114165866
23
3.0
23
80
2
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28
14
15
41
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23
2.6
22
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10
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44
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3
32
1.68
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2.1
30
100
0
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22
1.9
22
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0
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12
1.26
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2.0
22
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0
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0
0
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1.00
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0
0
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0
0
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2.0
22
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2
0
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51
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9
0
90
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114214240--114214270
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4
55
0
9
0
90
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2.0
19
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5
0
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0
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0
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70
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2
9
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1.45
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26
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0
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0
0
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0
0
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1.76
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19
4.6
20
72
20
53
58
0
0
41
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114241296--114241328
11
3.0
11
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50
57
0
0
42
0.98
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5.1
21
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21
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54
0
0
43
1.12
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51
3
0
45
1.17
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2.3
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157
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2
0
43
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2.0
77
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8
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0
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50
60
2
3
33
1.26

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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