Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  356  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
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2.2
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191
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1.9
160
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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G
T
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18
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11
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1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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10
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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0
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2.6
17
92
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53
0
2
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1.13
117888696--117888732
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17
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0
0
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25
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0
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20
1.9
19
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5
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0
2
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0
0
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0
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2.0
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0
0
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0
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6
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117903362--117903426
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117903362--117903463
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15
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20
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1.98
117918128--117918399
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43
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128
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21
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1.98
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128
2.6
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363
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25
1.99
117924135--117924631
140
3.6
138
80
8
518
31
22
18
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.4
266
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18
26
1.97
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2.0
124
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24
1.97
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2.3
141
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18
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1.97
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1.9
229
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2.2
221
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134
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2
5
28
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
117948886--117948982
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3
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61
2
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30
1.29
117949893--117949938
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2.4
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2.4
22
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1.9
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55
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0
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2.2
42
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132
35
20
13
30
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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