Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  339  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112687431--112687471
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1.65
112688330--112688503
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1.8
280
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1
942
25
17
19
37
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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0
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30
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2.7
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152
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16
10
36
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28
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23
20
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2.3
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1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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166
23
24
18
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1.97
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20
16
6
56
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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132
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19
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1.96
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4
0
34
1.16
112787781--112787805
8
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8
100
0
50
76
0
0
24
0.80
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30
2.0
31
82
14
76
30
17
3
48
1.63
112790944--112791027
36
2.3
36
77
4
89
22
57
10
9
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27
4.4
27
92
0
166
21
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14
17
1.84
112791014--112791119
54
2.0
54
88
0
158
24
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14
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54
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0
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23
46
13
16
1.82
112791053--112791171
54
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54
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0
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25
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1.79
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13
100
0
50
40
0
12
48
1.40
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1.35
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2.5
127
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405
27
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19
37
1.93
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16
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56
0
0
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2.0
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2.0
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1.82
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1.9
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29
3.2
29
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7
0
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1.16
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20
2.0
20
95
0
71
37
15
12
35
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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1.95
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41
3.7
41
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1.96
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26
1.95
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1.97
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0
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0
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25
25
2.00
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0
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0
0
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0
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0
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2.0
36
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0
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25
2
29
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11
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9
0
18
1.10
112915167--112915199
10
3.2
10
95
4
57
72
9
0
18
1.10
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
112915832--112915889
23
2.5
23
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29
1.65
112936493--112936525
17
1.9
17
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0
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1.83
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2.0
28
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0
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1.63
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28
2.0
28
100
0
112
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28
1.63
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39
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0
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78
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2
204
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0
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24
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1.9
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1.9
28
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0
90
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1
22
44
1.63

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362