Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  285  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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1.98
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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1
33
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
A
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33
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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(0-2)
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16
13
34
1.87
96060696--96060736
22
1.9
22
95
5
75
17
29
43
9
1.80
96062015--96062180
47
3.6
46
71
17
137
26
28
16
28
1.97
96061917--96062177
94
2.8
96
81
6
300
25
29
15
28
1.96
96064987--96065022
18
2.0
18
88
0
54
41
25
0
33
1.55
96069713--96069841
47
2.8
44
82
12
161
25
28
17
27
1.98
96069673--96069841
94
1.8
92
87
2
248
26
28
17
27
1.98
96076940--96076990
23
2.2
23
89
0
75
39
1
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49
1.47
96077430--96077479
10
5.0
10
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13
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22
8
2
68
1.26
96078184--96078274
39
2.3
39
81
11
96
30
9
1
58
1.38
96081090--96081138
3
16.7
3
76
19
50
24
2
0
73
0.94
96081093--96081139
15
3.1
15
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60
23
2
0
74
0.93
96081093--96081139
8
6.1
8
85
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71
23
2
0
74
0.93
96081093--96081139
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2.0
23
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23
2
0
74
0.93
96082244--96082425
96
1.9
97
88
1
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29
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24
30
1.96
96082442--96082472
15
2.1
15
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0
53
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0
3
9
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96083092--96083141
10
5.0
10
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13
59
22
8
2
68
1.26
96083865--96083942
39
2.0
39
89
2
120
24
14
3
57
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96084194--96084271
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2.1
38
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0
111
21
33
0
44
1.53
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25
2.6
25
100
0
132
19
24
24
31
1.98
96121418--96121479
29
2.1
29
85
5
81
58
3
6
32
1.40
96121983--96122014
16
2.0
16
100
0
64
25
6
0
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1.12
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10
10.8
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14
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34
4
1
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1.22
96122080--96122152
19
3.9
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26
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2
67
1.22
96122832--96122920
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2
115
31
15
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1.86
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20
2.2
19
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0
4
50
1.23
96126643--96126686
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2.1
21
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36
6
0
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1.26
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10
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10
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18
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31
4
1
63
1.20
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14
3.6
14
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32
5
0
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1.20
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2.1
35
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10
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32
4
1
61
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96138838--96139862
44
23.5
44
82
4
1103
31
14
26
27
1.95
96139384--96139502
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3.1
36
78
17
139
31
13
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24
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27
2.1
29
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40
22
6
30
1.79
96141148--96141211
25
2.6
24
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34
4
0
60
1.17
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160
2.0
158
98
1
622
31
8
12
48
1.70
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26
2.3
25
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43
3
1
51
1.28
96147720--96147796
26
3.0
25
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50
0
3
45
1.20
96147778--96147863
31
2.8
31
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3
129
51
2
6
39
1.42
96148723--96149261
126
4.3
126
90
0
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17
21
27
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96152222--96152836
116
5.3
116
96
1
1090
47
8
3
40
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
96153879--96153905
7
3.9
7
100
0
54
59
14
0
25
1.36
96153871--96153904
14
2.4
14
90
0
50
64
8
0
26
1.22
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2.1
15
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0
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0
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1.09
96155065--96155114
20
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22
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10
77
40
0
30
30
1.57
96155065--96155116
11
4.9
11
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42
0
28
28
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2.1
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5
85
42
0
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2.1
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2
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0
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26
27
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30
1.96
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46
2.7
44
82
6
132
26
19
30
24
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362