Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  8  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2631851--2631900
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2.0
24
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3
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20
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0
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101
2.1
101
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0
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2.1
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0
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2637830--2637861
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2.0
16
100
0
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6
6
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88
1.9
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2
202
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2642274--2642321
25
1.9
25
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0
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4
0
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1.14
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88
0
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59
0
0
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0.97
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2.0
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2
113
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3
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2651499--2651530
4
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0
0
50
1.00
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3
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20
29
29
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103
2.6
104
90
3
419
19
20
29
29
1.97
2665520--2665548
14
2.0
15
93
6
51
55
0
10
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1.34
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19
2.5
19
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12
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38
6
0
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1.25
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11
2.8
11
90
0
53
25
0
16
58
1.38
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16
1.9
17
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9
3
1.40
2677516--2677563
25
1.9
25
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0
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2
2
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35
90
0
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52
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20
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18
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28
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2.0
21
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9
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31
0
2
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100
0
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26
0
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2.8
36
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0
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43
15
5
37
1.68
2695093--2695140
25
1.9
25
82
0
60
33
29
0
37
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2695583--2695626
22
1.9
24
90
9
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25
20
0
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1.45
2696054--2696093
20
1.9
22
85
10
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42
0
2
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1.13
2698109--2698294
41
4.6
41
91
0
293
33
20
25
20
1.97
2698897--2698988
46
2.0
46
93
0
157
35
3
4
56
1.35
2706394--2706431
20
1.9
20
84
10
51
42
13
23
21
1.88
2708266--2708585
46
7.0
46
88
2
446
38
15
23
23
1.92
2712702--2712815
57
2.0
57
100
0
228
22
29
10
36
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20
2.3
21
85
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42
0
10
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1.38
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6.0
10
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11
50
30
0
5
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1.15
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21
2.0
22
90
9
70
37
0
2
60
1.10
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27
2.0
28
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3
83
62
12
11
12
1.54
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15
2.1
15
100
0
62
67
0
6
25
1.14
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7
4.4
7
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4
53
13
0
0
86
0.57
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15
7.2
15
70
12
87
43
7
22
26
1.79
2720017--2720131
30
3.8
30
96
0
194
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6
22
26
1.78
2724698--2724811
30
3.8
30
94
1
194
44
7
22
25
1.78
2728354--2728393
11
3.6
11
82
0
53
20
10
10
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1.57
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17
2.5
17
82
17
54
51
16
18
13
1.77
2735803--2735927
63
2.0
62
98
1
241
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3
22
38
1.70
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40
2.0
40
86
0
111
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20
7
30
1.80
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46
7.0
46
91
0
433
20
24
15
38
1.92
2742169--2742205
20
1.9
20
88
5
58
51
8
0
40
1.32
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2746250--2746391
70
2.0
70
95
0
257
36
9
7
45
1.66
2746347--2746407
24
2.5
23
80
15
61
44
4
3
47
1.41
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18
2.1
18
89
0
56
45
8
13
32
1.73
2760200--2760265
31
2.1
33
86
8
93
40
1
6
51
1.36
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2
14.0
2
100
0
56
50
0
0
50
1.00
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16
1.9
17
93
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57
43
12
0
43
1.42
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1.9
30
89
0
89
34
20
20
24
1.97
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16
2.2
18
85
9
51
56
8
2
32
1.43
2789732--2789785
22
2.5
21
80
11
56
24
16
25
33
1.96
2797680--2797744
23
2.8
23
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4
78
41
21
10
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1.86
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12
2.9
12
86
0
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14
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1.86
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3.2
26
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17
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42
1
2
53
1.21
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2.1
16
89
10
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58
0
0
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0.98
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2.3
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49
0
0
50
1.00
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2.1
15
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40
0
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1.27
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286
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4
649
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9
14
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18
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16
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13
4
0
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25
2.6
24
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9
58
39
1
0
59
1.07
2826196--2826236
20
2.2
20
86
8
59
48
7
0
43
1.30
2835497--2835558
22
2.6
24
82
14
76
35
1
4
58
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2842585--2842627
19
2.1
22
87
12
65
30
0
4
65
1.13
2842683--2842716
17
2.0
17
88
0
50
67
2
2
26
1.19
2842746--2842840
44
2.1
46
90
7
151
35
4
2
57
1.30
2843186--2843242
30
1.9
30
85
7
80
35
0
12
52
1.39
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3
12.7
3
83
10
51
28
0
2
68
1.03
2844970--2845008
15
2.6
15
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8
62
28
0
5
66
1.12
2845263--2845292
12
2.5
12
94
0
51
16
3
0
80
0.85
2850268--2850306
20
2.0
20
89
0
60
46
10
2
41
1.51
2851716--2851764
25
2.0
25
83
0
62
53
4
0
42
1.20
2852818--2852865
24
2.0
25
87
4
71
58
4
0
37
1.18
2856820--2856851
15
2.1
15
94
0
55
50
21
15
12
1.77
2859239--2859294
26
2.1
27
80
6
62
16
1
16
66
1.35
2859351--2859386
2
18.0
2
100
0
72
50
0
0
50
1.00
2860955--2861007
28
1.9
28
84
3
72
37
3
0
58
1.16
2862332--2862372
21
1.9
21
85
5
55
60
14
4
19
1.51
2862779--2862835
25
2.3
25
79
11
64
38
1
1
57
1.19
2867575--2867615
15
2.6
16
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11
50
24
0
9
65
1.22
2867578--2867615
16
2.4
17
82
13
53
26
0
10
63
1.27
2873590--2873690
50
2.0
50
100
0
202
34
11
11
41
1.79
2883014--2883086
36
2.0
36
100
0
146
50
5
5
38
1.49
2903208--2903364
84
1.8
86
82
9
205
40
1
2
54
1.25
2903972--2904011
19
2.2
19
86
8
57
70
2
0
27
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2904370--2904421
23
2.3
23
83
6
61
32
0
3
63
1.12
2909560--2909602
22
2.0
21
86
13
61
39
9
9
41
1.69
2919485--2919528
23
2.0
21
82
13
52
43
0
0
56
0.99
2932735--2932770
15
2.3
16
90
4
56
72
0
8
19
1.10
2932718--2932770
16
3.4
16
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10
65
67
0
5
26
1.12
2933551--2933637
40
2.2
40
89
0
129
34
6
17
41
1.76
2933841--2933937
45
2.2
45
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3
133
21
17
19
41
1.91
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29
2.1
29
100
0
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36
19
13
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1.90
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48
1.9
48
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12
111
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5
2
49
1.37
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43
7.5
43
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6
259
31
23
18
26
1.98
2951662--2951975
170
1.8
170
81
5
393
31
24
19
25
1.98
2951664--2951976
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3.7
84
82
6
321
31
24
19
24
1.98
2952275--2952322
21
2.3
21
96
0
87
0
56
18
25
1.42
2952878--2952915
19
2.1
18
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9
51
52
0
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39
1.31
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15
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27
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0
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23
2.0
23
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0
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21
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18
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17
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13
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52
0
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1.31
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15
2.3
15
89
5
50
27
9
0
63
1.24
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23
2.0
23
95
0
85
48
10
19
21
1.78
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24
2.7
24
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11
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42
4
0
53
1.22
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25
1.9
25
100
0
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39
25
6
29
1.80
2976486--2976561
39
2.0
38
85
7
102
40
23
5
30
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
2976741--2977001
41
6.4
41
91
0
371
18
22
24
33
1.97
2977601--2977641
15
2.7
15
88
0
64
34
17
7
41
1.77
2981890--2981919
9
3.3
9
90
0
51
23
3
10
63
1.40
2991045--2991136
39
2.4
39
88
0
130
33
35
13
17
1.88
2997607--2997668
31
2.2
27
83
13
72
41
16
3
38
1.64
3004225--3004269
7
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7
94
5
69
0
13
0
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0.57
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6
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2
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0
13
0
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0
14
0
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0.58
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2.4
24
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71
64
10
3
21
1.39
3004857--3004917
11
5.5
11
76
3
50
65
9
4
19
1.40

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362