Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  349  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115739480--115740257
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8.9
88
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8
817
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17
26
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115739530--115740257
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2.8
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0
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0
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0
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24
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1
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3.0
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115755947--115756004
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2.0
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2.0
20
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1
5
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19
2.3
21
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14
53
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0
4
17
0.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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4
0
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1.12
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60
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1
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2.1
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10
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2.0
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2.1
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0
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0
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2.0
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4.7
46
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1
258
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21
21
1.86
115809590--115809818
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2.5
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13
21
21
1.86
115810991--115811016
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3.2
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100
0
52
50
0
11
38
1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115811847--115812243
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132.3
3
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13
113
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6
28
1.37
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14
5.1
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6
72
59
2
2
34
1.27
115818370--115818412
19
2.2
20
83
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52
25
0
0
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0.82
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0
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67
1.07
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2.7
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42
1
4
52
1.27
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1.86
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5
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0
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2.0
21
85
4
57
39
0
2
58
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115901324--115901457
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3.4
40
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100
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16
26
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0
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69
55
0
0
44
0.99
115902431--115902485
7
7.7
7
84
15
53
54
0
0
45
0.99
115909138--115909195
26
2.2
26
93
0
98
36
24
5
34
1.78
115910106--115910215
47
2.3
47
81
6
134
36
21
15
26
1.93
115911017--115911047
4
7.8
4
92
0
53
3
25
0
70
1.02
115910977--115911079
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2.1
50
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163
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26
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60
1.47
115911072--115911102
14
2.2
14
94
0
53
22
16
0
61
1.34
115915293--115915421
38
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38
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4
170
19
20
27
33
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115917648--115917875
46
5.0
46
90
3
325
22
23
15
38
1.92
115925970--115926007
19
2.0
20
89
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47
0
2
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1.15
115927853--115927900
22
2.3
20
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13
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20
4
12
62
1.46
115927926--115927984
27
2.2
27
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6
66
57
3
6
32
1.41
115927940--115927993
27
2.0
26
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5
31
1.38
115930566--115930609
22
2.0
22
95
0
79
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2
18
47
1.61
115937182--115937223
5
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40
1.62
115939996--115940166
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4.9
35
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2
211
35
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29
1.92
115944546--115944587
19
2.2
19
86
0
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0
2
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1.9
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3
102
47
11
6
33
1.67
115957370--115957444
29
2.5
31
76
4
73
26
5
5
62
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115957423--115957474
24
2.2
24
86
6
72
25
1
9
63
1.35
115978337--115978393
18
3.4
18
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18
59
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17
7
33
1.76
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14
2.6
15
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53
57
2
0
39
1.12
115981017--115981151
58
2.3
57
84
5
173
42
2
2
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1.29
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11
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11
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3
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40
17
2
40
1.64
115994037--115994104
22
3.1
22
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36
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2
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1.65
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2
29
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1.73
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2.0
126
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0
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2.0
22
100
0
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0
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1.49
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2
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1.50
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62
0
31
6
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3.8
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0
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4
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2.7
27
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1
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116025912--116026314
177
2.3
175
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578
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4
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1.48
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2.0
21
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0
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21
29
1.98
116045684--116045763
31
2.7
29
73
9
72
53
6
11
28
1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
116048571--116048607
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1.9
19
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0
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0
0
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1.00
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2.0
23
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0
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0
0
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0.99
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0
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0
0
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1.00
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43
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10
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1.97
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2
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1.92
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2.9
22
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7
0
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0
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1.26
116053383--116053433
20
2.6
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5
0
35
1.22
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22
3.7
21
71
28
68
60
6
2
30
1.35

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362