Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  303  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Period
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Copy
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1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
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Score
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Period
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3
3
67
1.22
101784587--101784658
6
12.2
6
83
2
74
15
4
6
73
1.20
101784589--101784676
24
3.7
24
84
4
108
18
4
5
71
1.23
101784587--101784658
18
4.1
18
83
1
83
15
4
6
73
1.20
101786450--101786506
30
1.9
30
82
7
71
28
29
28
14
1.95
101793609--101793701
33
2.8
33
80
0
96
44
18
19
18
1.88
101795980--101796027
21
2.3
21
85
0
60
16
27
29
27
1.97
101801038--101801129
44
2.1
44
87
4
132
20
21
23
33
1.97
101806648--101806692
23
1.9
24
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13
58
71
2
11
15
1.24
101806648--101806695
24
2.0
24
84
8
62
70
2
10
16
1.24
101817083--101817115
17
1.9
17
93
0
57
24
9
9
57
1.58
101818849--101818885
13
2.8
13
95
0
65
8
27
45
18
1.77
101829556--101829613
31
1.9
30
89
10
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17
12
8
62
1.54
101830148--101830196
18
2.7
18
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12
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18
18
6
57
1.61
101835163--101835193
3
10.7
3
93
6
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0
0
29
0.87
101836786--101836831
23
2.0
23
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2
4
15
1.01
101878209--101878234
5
5.2
5
100
0
52
19
0
0
80
0.71
101884340--101884377
18
2.1
19
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5
60
73
0
2
23
0.95
101891429--101891454
13
2.0
13
100
0
52
15
38
30
15
1.88
101895932--101895978
20
2.3
20
89
7
69
34
10
21
34
1.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101896026--101896146
25
4.8
25
85
7
147
25
23
21
28
1.99
101896026--101896154
51
2.6
49
86
6
170
27
22
20
28
1.99
101896063--101896171
49
2.2
51
85
9
145
24
24
22
28
1.99
101896368--101896431
31
2.1
31
93
0
110
37
15
23
23
1.93
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22
2.3
22
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10
77
19
19
23
37
1.94
101899526--101899576
22
2.4
22
86
3
68
15
25
21
37
1.93
101899589--101899643
22
2.5
22
75
0
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20
30
1.94
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22
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35
1.94
101914217--101914325
42
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43
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1
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25
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1.96
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3.7
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25
16
25
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1.96
101920643--101920833
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27
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2.0
61
87
3
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28
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101930494--101930602
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2.6
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5
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23
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25
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100
0
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1.93
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2.0
44
84
0
117
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2.0
29
100
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37
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2.7
29
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0
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28
28
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5.4
8
80
5
50
7
21
21
50
1.72
101965724--101965753
15
2.0
15
100
0
60
6
20
26
46
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13
2.6
13
90
4
50
48
12
0
39
1.40
101970900--101970926
14
1.9
14
100
0
54
29
7
0
62
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
101971089--101971215
3
41.7
3
69
14
57
29
7
3
60
1.38
101983732--101984059
43
7.6
42
65
14
173
35
21
23
20
1.96
101983725--101984116
87
4.5
87
84
4
522
35
20
23
19
1.96
101983774--101983928
44
3.5
44
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12
120
35
21
24
18
1.95
101983725--101984107
43
8.8
44
64
14
168
34
21
24
19
1.96
101985594--101985620
14
1.9
14
100
0
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29
7
0
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1.22
101985781--101985927
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3
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2
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0
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24
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5
7.4
5
88
11
60
79
0
2
17
0.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362