Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  178  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
58726196--58726341
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3.0
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357
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2.0
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2.0
25
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2
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2.5
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3
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1.9
97
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30
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1.82
58746619--58746812
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4.1
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22
3.1
22
64
24
58
23
29
13
33
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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25
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22
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19
2.1
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2.1
21
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1.98
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58771157--58771735
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5.9
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31
25
6
36
1.81
58771157--58771735
148
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148
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1
1015
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20
2.0
19
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51
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28
17
28
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2.0
20
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2.0
72
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2.3
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23
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2.2
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27
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4
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2.3
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19
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26
2.9
26
71
11
64
43
21
13
21
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19
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27
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4
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10
100
0
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25
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100
0
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44
18
11
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1.83
58849028--58849215
59
3.2
59
66
11
150
41
3
3
51
1.35
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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6
49
1.39
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2.0
17
88
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52
45
0
0
54
0.99
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119
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118
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43
2
4
50
1.35
58849245--58849516
144
1.9
147
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478
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2
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1.35
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17
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0
0
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1.99
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1.93
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135
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18
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109
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9
16
38
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
58884098--58884222
36
3.4
36
80
6
126
36
9
16
36
1.82
58884165--58884215
18
2.8
18
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5
59
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13
39
1.74
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36
0
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1.42
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15
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15
84
5
83
49
36
0
13
1.43
58916938--58917196
43
6.0
43
93
0
455
22
19
33
24
1.97
58916938--58917196
129
2.0
129
99
0
509
22
19
33
24
1.97
58917271--58917351
31
2.5
31
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4
90
62
18
2
16
1.43
58917592--58917642
21
2.4
21
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0
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3
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29
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58923282--58923503
9
24.6
9
72
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125
38
0
13
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1.49
58923318--58923502
41
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39
1
12
47
1.49
58923258--58923475
114
1.9
114
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5
302
38
0
12
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1.48
58923397--58923493
50
1.9
50
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1
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58923608--58923663
15
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15
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0
0
46
1.00
58923840--58923907
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24
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1.76
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10
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0
0
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15
2.1
15
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18
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1.95
58930148--58930328
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4.5
41
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2
330
17
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24
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1.95
58930149--58930368
41
5.4
40
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3
282
18
21
23
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1.95
58937184--58937405
39
5.7
39
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11
188
25
28
20
25
1.99
58937337--58937414
40
1.9
41
82
10
97
26
28
20
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
13
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0
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7
22
1.75
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22
2.0
22
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59
26
23
4
45
1.73
58950381--58950612
49
4.7
49
81
7
279
30
26
17
25
1.97
58950367--58950612
100
2.5
99
84
4
316
29
26
17
25
1.98
58953334--58953372
15
2.5
15
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1.68
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49
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28
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26
1.98
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2.2
22
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22
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15
2.3
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22
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100
0
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0
0
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20
6
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1.29
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19
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0
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0
0
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2
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0
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0
2
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1.12
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2
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1
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37
1.25
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23
0
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58985236--58985278
23
1.9
22
85
4
59
55
2
4
37
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
58985394--58985462
21
3.3
21
83
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62
0
1
36
1.04
58985383--58985463
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5
130
59
0
1
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1.05
58985391--58985463
20
3.6
20
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101
61
0
1
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2.6
25
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2.0
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0
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0
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27
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18
2.0
19
89
10
58
11
30
44
13
1.79

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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