Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  23  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6799714--6799769
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21
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0
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2.0
27
100
0
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27
2.1
27
93
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18
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1.93
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2.0
81
98
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2.0
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0
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0
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48
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6
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19
28
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98
1.8
97
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222
29
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19
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19
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131
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19
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2.0
21
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2.0
20
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0
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0
35
0
0.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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5
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0
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0
0
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0.68
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20
2.8
20
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10
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56
5
5
32
1.45
6873218--6873351
27
5.3
26
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12
111
58
2
4
34
1.30
6873292--6873351
13
4.8
13
78
11
54
61
0
3
35
1.12
6873249--6873448
27
7.4
26
70
18
106
56
3
4
36
1.37
6873386--6873448
24
2.6
24
83
11
76
52
4
4
38
1.44
6873498--6873551
22
2.5
20
77
13
54
53
7
3
35
1.47
6875400--6875595
77
2.6
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8
243
31
22
18
27
1.97
6875408--6875836
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75
77
13
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33
20
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1.95
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14
2.1
14
93
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6
10
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2
248
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18
16
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1.93
6875408--6875832
161
2.7
151
80
11
500
32
20
17
28
1.95
6875407--6875836
237
1.8
237
88
3
668
33
20
17
28
1.96
6884506--6884562
4
15.0
4
75
10
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52
1
21
24
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6884510--6884562
22
2.3
23
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63
52
1
20
24
1.56
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20
2.7
20
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11
65
55
9
5
29
1.54
6888525--6888568
21
2.1
21
87
4
63
52
9
6
31
1.59
6888504--6888595
47
2.0
46
87
6
132
55
6
4
33
1.45
6888488--6888644
27
6.2
26
71
17
116
57
5
4
33
1.41
6888580--6888644
13
4.8
13
74
12
51
66
3
3
27
1.22
6888611--6888664
24
2.4
22
81
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63
61
1
3
33
1.25
6888600--6888729
64
2.0
65
82
11
160
58
2
5
33
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6888681--6888743
24
2.6
24
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11
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52
4
4
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1.44
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23
2.0
23
100
0
90
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8
13
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75
2.0
75
97
0
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22
18
24
34
1.96
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220
2.0
220
99
0
870
31
32
15
19
1.93
6896672--6896724
26
2.0
26
82
7
63
26
15
20
37
1.92
6898209--6898316
26
4.2
26
95
0
198
35
26
7
30
1.84
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1.9
20
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0
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15
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0
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3
85
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0
5
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1.21
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11
2
0
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1.9
21
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0
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0
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2.0
21
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0
73
48
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9
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1.36
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3
52
27
2
6
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1.33
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11
3.7
11
78
15
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28
0
2
69
1.01
6917985--6918026
17
2.4
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11
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28
0
2
69
1.01
6921330--6921519
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2.1
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3
213
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13
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1.92
6925705--6925760
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1
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2.0
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5
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33
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2.3
33
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136
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16
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1.93
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27
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25
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13
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1.60
6947367--6947425
30
2.0
30
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0
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18
50
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1.73
6947415--6947440
12
2.2
12
100
0
52
23
61
7
7
1.49
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6947346--6947574
72
3.2
71
75
3
192
20
51
8
20
1.72
6947448--6947573
30
4.2
30
84
2
146
21
52
7
18
1.70
6947388--6947509
42
2.9
42
79
4
131
21
52
6
19
1.68
6947543--6947607
33
2.0
33
90
0
103
21
47
6
24
1.73
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99
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96
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6
261
19
51
8
21
1.73
6947601--6948324
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10.1
72
72
8
337
17
53
9
19
1.71
6947721--6948005
30
9.2
30
76
9
139
20
52
8
18
1.70
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33
3.8
33
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50
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1.69
6947844--6947878
18
1.9
18
88
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52
17
51
8
22
1.72
6947672--6948030
189
1.9
188
87
2
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19
52
8
19
1.70
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21
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20
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20
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6948078--6948115
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3.4
12
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15
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6948273--6948412
48
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20
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17
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15
2.0
15
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30
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1.64
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18
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30
2.1
30
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20
2.0
19
90
5
60
38
5
2
53
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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0
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0
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2
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2
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0
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0
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22
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32
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0
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18
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0
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0
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19
2.1
18
85
9
51
52
0
7
39
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6984506--6984537
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15
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0
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3.2
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2
340
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20
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6985567--6985853
40
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4
313
20
22
19
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2.4
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17
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2.0
16
93
0
55
50
6
21
21
1.71

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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