Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  75  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23454972--23455015
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0
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1.99
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0
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2.6
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18
26
1.98
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7.5
50
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25
16
26
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.8
101
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6
255
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15
26
1.95
23513774--23514159
151
2.6
151
91
3
625
31
25
16
26
1.97
23519297--23519442
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2.0
72
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172
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23
1.97
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2.0
20
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20
0
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22
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72
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11
22
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2.0
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22
3.0
22
70
12
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21
10
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1.86
23530293--23530351
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13
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1.90
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57
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81
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868
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15
28
1.96
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254
2.4
257
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902
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15
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3.1
88
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313
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24
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1.97
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170
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175
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11
88
1
15
0
82
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23544869--23544930
19
3.2
20
78
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67
1
16
0
82
0.75
23551461--23551524
32
1.9
32
84
6
83
53
3
4
39
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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16
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2.1
15
100
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34
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21
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1.79
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64
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14
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131
27
22
12
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1.90
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3.6
13
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2
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64
2
2
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1.16
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14
3.4
14
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2
2
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1.15
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1
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29
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23589259--23589306
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2
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1.41
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29
1.96
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23
2.1
24
82
10
59
50
20
4
26
1.66
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23629913--23630090
27
6.6
27
83
3
196
26
14
29
29
1.95
23629913--23630090
54
3.3
55
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4
236
26
14
29
29
1.95
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28
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21
21
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49
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155
25
28
19
26
1.99
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67
2.2
68
81
10
186
32
16
29
21
1.95
23648810--23648884
27
2.8
26
84
6
87
32
13
17
37
1.88
23648820--23648872
27
2.0
27
92
0
88
32
13
16
37
1.88
23649098--23649133
17
2.0
19
89
10
58
13
38
33
13
1.85
23654945--23655079
51
2.7
50
77
5
139
30
23
18
27
1.98
23673246--23673305
27
2.3
26
82
2
66
36
20
21
21
1.95
23675237--23675297
30
2.0
30
87
0
86
39
6
22
31
1.80
23688571--23688754
40
4.6
40
81
6
187
23
21
27
27
1.99
23688651--23688801
40
3.8
39
80
6
117
24
22
28
24
1.99
23696712--23696897
81
2.3
81
94
0
327
30
10
17
42
1.82
23703804--23703864
20
3.0
20
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9
79
42
21
24
11
1.86
23723472--23723621
43
3.5
42
73
10
117
26
19
26
28
1.99
23739930--23739986
25
2.3
25
84
0
78
24
21
24
29
1.99
23758757--23758941
39
4.7
39
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0
280
31
29
19
19
1.96
23764770--23764949
46
3.8
46
79
13
211
28
29
21
20
1.98
23767334--23767396
15
4.3
15
76
9
67
58
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15
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1.63
23770138--23770318
46
3.8
46
79
12
211
29
29
19
21
1.98
23774942--23775122
39
4.6
39
92
0
299
29
29
20
19
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23783520--23783664
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3.6
40
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4
193
25
24
26
23
2.00
23786936--23787010
27
2.8
27
79
0
69
34
18
20
26
1.95
23787014--23787253
27
8.9
27
88
1
302
31
21
5
41
1.77
23787006--23787253
81
3.1
81
86
0
352
31
21
5
41
1.77
23787489--23787540
27
2.0
26
84
3
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17
26
21
34
1.95
23787784--23787885
6
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15
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20
19
11
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1.80
23787784--23787876
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2.5
37
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0
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20
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29
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28
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1.96
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0
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20
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16
2.7
16
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3
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11
22
18
47
1.80
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27
6.6
27
92
3
268
24
14
17
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1.87
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18
3.2
18
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5
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21
15
14
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1.80
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19
2.1
19
85
0
51
71
7
5
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1.26
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3.2
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19
1.95
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2.2
28
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0
88
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29
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1.89
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1.9
100
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2
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1.98
23809746--23809933
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49
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4
243
29
26
18
26
1.98
23816996--23817033
4
10.0
4
88
5
53
23
0
0
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10.8
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0
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32
9
28
29
1.88
23823581--23823628
23
2.1
23
100
0
96
29
16
33
20
1.95
23823534--23823673
70
2.0
70
90
2
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31
13
30
24
1.93
23823604--23823696
47
2.0
47
87
4
134
33
10
31
24
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23823819--23823897
37
2.1
37
90
0
122
24
18
31
25
1.98
23824825--23824919
45
2.1
45
100
0
190
20
8
13
57
1.61
23828043--23828187
40
3.6
40
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4
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25
24
26
24
2.00
23832300--23832419
22
5.3
23
77
8
93
38
20
17
24
1.93
23832295--23832396
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2.3
45
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109
36
20
18
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1.95
23835461--23835605
40
3.6
40
85
4
184
24
26
24
25
2.00
23855640--23855753
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2.1
54
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24
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0
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2.1
81
84
2
224
25
17
18
39
1.92
23859671--23859896
49
4.5
49
80
8
285
29
25
18
26
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362