Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  348  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115558587--115558631
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42
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115564156--115564318
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20
25
20
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1.97
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1.9
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81
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25
19
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1.97
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1.99
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2.0
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2.4
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50
2
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4
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2.1
22
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3
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1.37
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11
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4.2
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4.5
207
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22
17
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2.2
413
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29
22
17
30
1.97
115578303--115578503
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2.4
82
78
12
230
21
21
25
30
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115579432--115579500
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10
0
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0.60
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1.81
115585212--115585362
35
4.2
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257
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2
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2.0
21
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0
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2.3
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3
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20
2.0
20
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4
4
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25
5
0
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2.0
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14
34
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1
7
61
1.35
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3.5
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75
19
59
43
47
0
9
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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45
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0
0
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2.0
93
94
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337
33
3
4
58
1.34
115622183--115622302
19
6.4
19
65
19
63
34
2
4
59
1.30
115622573--115622628
21
2.6
23
77
13
64
30
5
7
57
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80
2
2
14
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3
109
73
6
3
17
1.17
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2.0
20
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0
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4
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0
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115671995--115672427
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0
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2.7
19
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11
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34
7
9
48
1.65
115673973--115674020
22
2.0
25
84
11
66
39
12
2
45
1.54
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9
3.0
9
100
0
54
55
0
11
33
1.35
115676741--115676791
25
2.2
23
83
13
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47
9
7
35
1.66
115677368--115677406
15
2.6
15
83
0
51
61
7
0
30
1.24
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16
2.1
18
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10
58
58
0
0
41
0.98
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44
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19
21
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14
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13
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14
28
1.73
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18
28
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115679761--115679790
14
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14
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0
51
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10
13
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100
1.9
100
91
0
309
36
18
17
27
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73
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2
424
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21
16
28
1.95
115679865--115680175
148
2.1
147
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2
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33
21
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28
1.95
115681846--115682017
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0
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20
1.98
115681839--115682014
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3.8
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20
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0
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0
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1.35
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16
2.1
18
90
10
58
58
0
0
41
0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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14
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0
0.93
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1.9
29
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2
0
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27
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27
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54
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2
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0
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1.83
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2.1
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23
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6
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19
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24
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11
137
19
18
14
48
1.82
115732767--115732933
19
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19
73
20
116
19
18
14
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2.2
37
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0
121
18
18
18
45
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2.8
62
91
0
281
19
18
14
47
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
115732857--115732935
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2.1
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0
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46
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115732872--115732950
37
2.1
37
90
0
122
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2.8
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3
28
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3.0
22
76
20
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3
31
1.50
115737297--115737354
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2.0
72
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202
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0
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21
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2.2
104
82
2
290
42
15
17
25
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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