Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  92  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29528157--29528329
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46
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22
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1.8
78
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200
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22
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29579823--29579986
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2.1
78
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22
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22
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40
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225
25
28
22
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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100
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0
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29649388--29649456
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120
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29
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1.95
29653213--29653390
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3.3
54
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232
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29
14
26
1.95
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1.9
82
88
3
235
29
29
14
26
1.95
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27
6.6
27
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1.96
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236
29
28
15
26
1.96
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2.2
80
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7
235
25
26
20
26
1.99
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1.9
120
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27
21
26
1.99
29669354--29669578
40
5.7
39
82
8
226
25
26
21
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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55
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1.95
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2.7
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1.95
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2.5
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1.97
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1.97
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28
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Size
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Score
A
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(0-2)
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67
1.18
29727482--29727693
40
5.3
40
86
3
232
24
21
26
28
1.99
29730438--29730498
30
2.0
30
100
0
122
36
27
3
32
1.73
29732222--29732265
20
2.3
19
84
11
54
27
29
18
25
1.98
29732888--29732920
8
4.1
8
92
0
57
3
24
24
48
1.65
29738322--29738373
25
2.1
25
100
0
104
40
7
3
48
1.50
29738884--29738914
16
1.9
16
93
0
53
35
22
0
41
1.54
29738881--29738920
20
2.0
20
85
0
53
37
22
0
40
1.54
29739107--29739361
55
4.8
53
80
8
245
21
24
18
35
1.95
29739153--29739353
108
1.8
110
89
4
318
21
25
18
33
1.97
29744868--29745068
108
1.8
109
88
4
307
21
25
17
34
1.95
29744821--29745076
55
4.8
54
80
6
229
20
25
17
36
1.94
29746960--29746984
11
2.3
11
100
0
50
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0
0
28
0.86
29747890--29748008
43
2.8
42
78
5
123
29
25
15
29
1.96
29757633--29757669
16
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16
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0
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0
10
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17
2.7
18
83
9
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62
0
0
37
0.95
29761159--29761218
29
2.1
29
100
0
120
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10
13
26
1.73
29762984--29763120
46
3.0
46
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0
211
26
31
8
34
1.85
29764830--29765012
79
2.3
82
83
7
225
24
21
27
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29764830--29765014
40
4.7
40
83
6
225
24
21
27
27
1.99
29764866--29765047
79
2.3
77
79
11
197
26
20
26
26
1.99
29772883--29773067
40
4.7
40
84
7
227
23
22
28
25
1.99
29772883--29773065
79
2.3
81
85
7
241
24
22
27
25
2.00
29772884--29773100
79
2.7
78
79
12
237
25
21
27
25
1.99
29774447--29774651
47
4.4
47
93
0
322
25
28
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1.88
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3.3
22
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16
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1.91
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3
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0
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0
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0.88
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12
215
28
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29
23
1.98
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2
241
30
26
17
26
1.97
29790232--29790415
100
1.8
100
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323
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27
17
25
1.97
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2.0
30
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0
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29
21
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1.78
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7
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0
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0
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12
1.04
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181
27
19
29
23
1.98
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40
4.9
40
90
1
302
22
27
22
27
1.99
29808637--29808857
80
2.8
80
86
4
306
21
27
23
28
1.99
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6
11.3
6
90
3
91
78
4
0
16
0.90
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17
1.9
18
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11
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42
18
24
15
1.88
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14
2.1
14
100
0
60
26
0
0
73
0.84
29825465--29825502
14
2.8
14
88
4
51
28
2
2
65
1.19
29831526--29831569
22
2.0
22
91
8
72
34
29
4
31
1.78
29837172--29837239
36
2.0
32
83
11
82
22
26
20
30
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
29843520--29843604
32
2.7
32
92
0
134
25
18
27
28
1.98
29854518--29854729
47
4.5
45
74
12
169
25
20
31
22
1.98
29857523--29857690
43
3.9
43
76
9
139
28
25
19
26
1.99
29857523--29857690
85
2.0
85
82
4
205
28
25
19
26
1.99
29864342--29864559
47
4.7
45
73
11
165
28
20
28
22
1.98
29866272--29866473
43
4.7
43
85
6
266
29
27
17
25
1.97
29873973--29874261
99
2.9
99
82
3
350
33
25
16
24
1.96
29873963--29874261
49
6.0
50
81
3
311
32
25
17
24
1.97
29873980--29874386
25
16.4
25
72
13
193
32
24
17
26
1.97
29874252--29874440
50
3.8
50
75
4
175
31
23
16
27
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362