Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  344  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
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1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
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Score
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24
1.96
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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Period
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A
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20
1.89
114436161--114436207
25
2.0
25
83
8
62
53
4
14
27
1.60
114444248--114444282
18
1.9
18
94
0
61
31
17
22
28
1.96
114444204--114444324
62
2.0
62
89
0
188
31
15
24
28
1.96
114444266--114444478
44
4.8
44
88
0
282
31
13
28
26
1.94
114446145--114446217
14
5.8
13
72
23
50
35
5
0
58
1.21
114446102--114446220
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1
58
1.30
114446151--114446227
29
2.6
29
80
8
93
33
3
0
62
1.14
114446158--114446215
30
2.0
29
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34
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60
1.19
114446187--114446231
21
2.2
20
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4
63
33
4
0
62
1.15
114449790--114450095
135
2.3
131
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35
19
18
26
1.95
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1.9
238
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0
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47
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22
1.81
114452875--114452913
20
2.0
20
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10
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7
23
51
17
1.71
114471437--114471500
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2.1
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100
2.0
100
98
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2.0
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2.0
17
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0
59
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0
0
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1.00
114481494--114481570
29
2.5
30
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1.70
114484779--114484817
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2.0
20
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0
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17
10
48
1.78
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15
3.9
14
78
15
55
56
0
10
33
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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54
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0
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10
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0
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1.31
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14
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0
0
70
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12
2.2
12
100
0
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7
23
1.78
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2.2
13
100
0
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1.80
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2.0
28
100
0
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0
4
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0
5
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3
52
1.23
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2.0
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18
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0
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0
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5.1
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24
20
1.97
114544723--114544927
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5.0
41
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22
24
20
1.97
114544723--114544927
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2.5
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292
32
22
24
20
1.97
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3.5
15
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1
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1.63
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2
147
29
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23
26
1.99
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50
0
2
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2.9
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133
27
17
22
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1.97
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21
1.9
21
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0
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20
20
30
30
1.97
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14
20
33
1.92
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45
2.6
45
86
10
148
21
21
29
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114567309--114567365
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8.7
7
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50
0
0
49
1.00
114567307--114567365
14
4.0
14
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49
0
0
50
1.00
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14
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2
24
1.31
114576394--114576427
14
2.4
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50
0
0
50
1.00
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2
0
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0
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0
0
0.47
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0
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5
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0
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0
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3.3
23
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0
132
33
28
21
17
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362