Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  251  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
84864778--84864876
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9
23.0
9
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14
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1
33
1.57
84864975--84865106
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3.5
36
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151
46
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1.60
84864889--84865106
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2.6
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20
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84889134--84889235
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152
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3
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1.74
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4.2
26
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5
24
35
1.79
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.9
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233
26
15
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29
1.96
84901772--84901952
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2.2
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2
229
27
15
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1.9
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2.0
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1.34
84923184--84923233
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1
313
23
23
27
25
2.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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2.0
17
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86
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18
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1.98
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224
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0
13
44
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85004663--85004714
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5.1
10
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1.20
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28
2
0
69
1.00
85013040--85013229
97
2.0
97
88
4
285
29
12
24
33
1.92
85013821--85013858
13
2.8
13
88
4
58
42
0
13
44
1.43
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24
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0
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20
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15
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75
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2.5
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1.47
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2
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2
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0
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0
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48
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1.62
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1.97
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0
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1.92
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16
1.9
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1.96
85063533--85063731
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1.8
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23
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1.96
85069099--85069189
44
2.1
44
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4
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28
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10
49
1.72
85069289--85069342
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2.6
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8
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12
0
20
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1.24
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43
3.5
43
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180
33
22
15
28
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.9
25
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8
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1.82
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364
3.0
364
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0
2007
32
23
13
30
1.93
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49
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0
124
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9
28
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13
3.0
13
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0
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2.4
108
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44
1.63
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2
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55
1
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36
1.34
85111170--85111247
27
2.9
26
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56
1
5
37
1.30
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17
2.1
17
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18
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0
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1.08
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27
2.6
27
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0
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26
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27
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26
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85126573--85126684
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2.1
54
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156
16
23
24
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1.95
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24
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14
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0
0
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29
2.9
29
78
11
95
32
5
4
56
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
85154818--85154925
26
4.2
26
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0
189
37
25
5
31
1.79
85160620--85160727
26
4.2
26
97
0
198
36
25
7
31
1.83
85161417--85161459
13
3.5
12
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12
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2
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2.1
17
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0
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0
0
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0
0
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0
0
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37
2.1
36
94
2
132
46
17
4
32
1.66

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362