Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  230  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.0
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2.3
19
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0
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38
1.43
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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T
Entropy
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77971606--77971729
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93
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166
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0
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27
1.33
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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252
25
19
20
33
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78049534--78049738
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20
33
1.97
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64
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52
10
3
33
1.53
78069311--78069348
12
2.9
14
84
15
62
36
15
13
34
1.87
78073599--78073654
27
2.1
27
83
6
69
41
5
3
50
1.43
78074438--78074657
114
1.9
115
83
4
284
29
18
22
29
1.97
78074692--78074741
14
3.4
15
78
13
59
22
0
36
42
1.54
78075248--78075292
14
3.0
15
80
9
56
40
37
0
22
1.54
78075310--78075363
22
2.5
22
88
8
76
50
24
0
25
1.50
78075818--78075910
42
2.2
42
84
0
114
21
2
33
43
1.65
78075847--78075916
21
3.3
21
82
7
97
15
1
38
44
1.56
78075847--78075902
14
4.0
14
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17
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16
1
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42
1.58
78075835--78075928
42
2.2
42
92
0
152
18
3
31
46
1.64
78075863--78075931
21
3.3
21
82
8
95
15
4
33
46
1.66
78078937--78079042
50
2.2
49
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6
126
39
11
5
43
1.64
78079920--78080012
45
2.1
45
83
0
114
46
17
3
33
1.64
78085127--78085155
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2.1
14
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6
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34
0
10
55
1.34
78086690--78086765
37
2.1
37
100
0
152
34
26
2
36
1.71
78087293--78087374
40
2.0
40
97
0
155
41
12
14
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1.83
78088579--78088677
50
2.0
49
84
7
128
59
11
11
18
1.60
78090884--78091083
104
1.9
103
86
3
285
48
13
15
23
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78093430--78093589
76
2.1
77
87
3
225
23
25
15
35
1.94
78100153--78100206
27
2.0
27
85
0
72
38
7
14
38
1.75
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49
3.9
49
81
2
246
25
19
26
29
1.99
78100465--78100646
100
1.8
100
93
0
319
25
19
25
29
1.99
78100469--78100679
100
2.1
99
85
5
273
26
19
25
28
1.99
78106019--78106072
27
2.0
27
85
0
72
38
7
14
38
1.75
78106321--78106488
51
3.3
51
88
1
232
27
22
22
27
1.99
78109495--78109783
147
2.0
147
85
1
391
39
15
10
35
1.81
78110460--78110734
146
1.9
147
87
3
403
39
16
8
35
1.79
78117932--78117989
30
1.9
31
85
3
82
41
8
18
31
1.81
78119417--78119592
46
3.8
45
79
10
203
21
20
29
28
1.98
78119414--78119584
93
1.8
93
93
0
297
21
21
29
28
1.98
78122527--78122570
15
2.9
15
80
12
54
11
15
15
56
1.66
78124508--78124683
46
3.8
45
78
10
194
20
21
28
29
1.98
78124505--78124675
93
1.8
93
92
0
288
20
21
29
28
1.98
78133143--78133174
16
2.1
15
94
5
55
50
28
18
3
1.62
78133385--78133446
26
2.3
27
86
10
92
37
27
8
27
1.85
78133551--78133664
27
4.2
27
79
11
126
20
22
21
35
1.96
78133551--78133660
55
2.0
54
84
5
141
20
22
20
36
1.95
78142068--78142112
20
2.3
20
88
3
65
28
17
26
26
1.98
78142141--78142254
28
3.9
28
71
19
81
27
21
26
25
1.99
78142136--78142277
61
2.3
61
84
8
173
27
20
26
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
78143044--78143076
18
1.9
17
88
11
50
42
12
15
30
1.83
78145334--78145373
18
2.4
16
91
8
62
25
7
2
65
1.32
78146048--78146075
5
5.6
5
100
0
56
21
0
0
78
0.75
78152181--78152229
17
2.8
17
80
20
57
30
0
4
65
1.11
78152673--78152726
17
2.9
18
83
8
65
14
7
0
77
0.97
78154160--78154207
17
2.8
16
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9
51
16
4
4
75
1.12
78157175--78157350
42
4.2
41
72
4
127
32
25
13
28
1.94
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39
92
0
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26
1.98
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39
4.9
39
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1
148
22
22
30
25
1.99
78164838--78165004
78
2.1
78
86
4
221
22
22
29
25
1.99

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362