Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  207  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
69953818--69954046
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1.39
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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C
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T
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73
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2
474
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19
19
32
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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1.42
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12
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0
31
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70146489--70146550
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17
5
34
1.73
70159593--70159667
23
3.3
22
80
10
80
42
6
16
34
1.74
70159595--70159669
22
3.4
21
78
12
71
41
6
17
34
1.76
70159650--70159678
14
2.1
14
100
0
58
44
0
13
41
1.44
70159630--70159702
37
2.0
36
84
7
94
42
5
15
36
1.70
70159795--70159950
54
2.9
54
83
1
152
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19
26
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70160039--70160368
108
3.1
107
82
1
374
39
13
16
30
1.88
70160053--70160402
54
6.5
54
80
2
299
37
13
17
31
1.88
70163537--70163627
46
2.0
46
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4
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26
32
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34
1.82
70163641--70163901
47
5.6
47
93
0
414
27
29
12
31
1.93
70163607--70163932
94
3.5
94
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7
412
27
30
11
30
1.91
70163811--70163884
23
3.2
23
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24
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31
29
10
28
1.91
70163641--70163932
47
6.2
47
91
0
404
28
29
11
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1.91
70168356--70168492
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25
26
1.99
70168884--70168925
19
2.2
19
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8
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2
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33
1.51
70171532--70171760
47
5.1
47
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8
314
34
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28
27
1.88
70171621--70171708
40
2.2
39
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4
158
35
11
27
26
1.90
70171574--70171747
87
2.0
86
94
1
303
33
10
28
27
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70171735--70171962
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5.0
46
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0
377
34
9
32
24
1.87
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40
3.3
40
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0
219
24
20
28
27
1.99
70173445--70173596
80
1.9
79
86
4
216
24
21
26
26
1.99
70173636--70173764
29
4.5
28
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22
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1.95
70173604--70173792
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57
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2
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22
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1.97
70173608--70173764
28
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1.97
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38
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0
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70177575--70177814
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1.8
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1.90
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46
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0
285
35
10
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1.88
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40
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1.99
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40
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1
173
25
27
23
23
2.00
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2.5
13
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50
47
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2
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1.60
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2.1
54
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0
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18
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23
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2.0
22
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29
2.0
30
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53
3
17
25
1.59
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2
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46
0
0
53
1.00
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2.1
19
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38
7
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48
1.54
70232669--70232725
25
2.2
25
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60
33
8
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70232983--70233035
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1.9
28
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24
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70233223--70233272
23
2.0
23
81
11
55
20
12
6
62
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
70238848--70238947
28
3.6
28
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0
101
27
31
11
31
1.91
70238958--70239043
40
2.2
39
89
2
127
27
29
17
25
1.97
70240820--70240867
20
2.5
20
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64
2
6
27
1.28
70240862--70240924
27
2.3
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50
11
0
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2.0
15
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0
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0
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0
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70254257--70254305
19
2.6
19
93
0
80
18
24
12
44
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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