Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  289  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.71
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Period
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Copy
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Percent
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Indels
Score
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26
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39
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126
21
22
29
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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22
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0.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
97359980--97360010
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11
1.84
97367192--97367759
126
4.5
125
88
0
796
27
19
16
36
1.93
97367192--97367759
251
2.3
252
88
1
827
27
19
16
36
1.93
97368634--97368749
60
1.9
62
85
3
164
31
11
13
43
1.80
97370880--97370976
39
2.6
38
80
3
106
29
23
18
27
1.98
97384593--97384627
17
2.1
17
94
0
61
42
5
0
51
1.25
97384792--97384821
11
2.7
11
100
0
60
30
10
13
46
1.75
97387375--97387420
22
2.1
22
80
4
58
39
17
28
15
1.90
97389274--97389435
33
4.9
33
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4
175
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20
11
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1.89
97389313--97389435
65
1.9
65
84
0
165
34
21
11
33
1.89
97389430--97389496
29
2.3
29
94
0
116
25
28
10
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1.89
97398067--97398210
42
3.3
42
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8
164
29
27
14
29
1.95
97398133--97398307
47
3.7
48
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6
205
29
26
16
28
1.96
97398133--97398307
49
3.7
48
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9
191
29
26
16
28
1.96
97398136--97398307
95
1.8
94
85
5
240
29
26
16
27
1.97
97398325--97398473
31
4.8
31
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4
212
27
26
18
27
1.98
97398449--97398577
50
2.5
51
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2
197
24
21
17
35
1.95
97400781--97400942
33
4.9
33
86
6
186
33
20
11
33
1.89
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
94
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1
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26
21
23
28
1.99
97414531--97414570
13
3.1
13
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0
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17
35
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17
1.93
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17
2.4
17
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4
53
0
33
0
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0.92
97436200--97436235
18
2.1
18
89
5
56
13
25
44
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1.85
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0
12
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1.33
97438161--97438426
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71
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0
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0
13
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0
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1.34
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22
2.0
21
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61
0
7
30
1.22
97438209--97438473
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10
295
61
0
13
24
1.35
97438208--97438486
21
12.1
21
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23
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0
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1.33
97438187--97438526
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15
194
62
0
12
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26
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18
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60
0
13
25
1.33
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11
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10
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1.44
97438519--97438608
17
5.5
17
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13
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58
1
16
23
1.44
97438519--97438608
6
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77
15
65
58
1
16
23
1.44
97438340--97438611
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2.2
123
79
10
284
61
0
13
24
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97438974--97439015
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2.0
22
90
4
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61
0
14
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1.32
97438993--97439031
16
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16
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53
64
0
12
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1.28
97439104--97439204
5
18.0
5
71
20
67
52
0
16
30
1.44
97439108--97439203
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52
0
16
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97439120--97439181
17
3.6
18
74
10
67
50
0
17
32
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
97439104--97439204
28
3.4
28
75
16
103
52
0
16
30
1.44
97439156--97439204
16
3.3
16
72
21
52
57
0
14
28
1.38
97439227--97439344
18
5.9
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2
9
28
1.42
97439330--97439426
5
17.4
5
74
16
59
60
3
16
19
1.48
97439330--97439426
11
8.7
10
72
17
59
60
3
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1.48
97441903--97442245
87
3.9
89
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16
228
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97442096--97442322
90
2.5
90
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44
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0
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2.0
18
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54
60
22
0
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1.37
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20
2.1
22
88
8
67
33
20
33
13
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362