Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  27  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.8
31
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104
43
11
15
30
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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7
47
1.31
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8125733--8125758
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3
52
1.42
8126649--8126736
40
2.2
40
85
4
115
38
5
2
53
1.37
8126776--8126926
71
2.1
71
92
2
250
51
2
2
43
1.29
8126986--8127045
8
7.0
8
82
14
66
50
0
1
48
1.11
8127014--8127159
77
1.9
79
84
5
199
47
3
5
43
1.43
8129355--8129456
30
3.4
30
77
11
111
25
23
21
29
1.99
8130139--8130212
37
2.0
37
94
0
130
40
21
5
32
1.76
8132817--8132858
21
2.0
21
85
4
57
54
0
0
45
0.99
8132839--8132913
32
2.3
32
95
0
132
48
4
5
42
1.44
8132841--8132925
32
2.5
33
88
9
127
51
3
4
40
1.40
8132937--8132971
13
2.8
13
91
8
56
57
0
0
42
0.99
8133006--8133053
25
2.0
25
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4
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54
2
2
41
1.24
8133138--8133186
21
2.3
20
80
13
62
53
0
0
46
1.00
8132920--8133178
114
2.3
112
78
14
312
53
2
3
39
1.33
8133220--8133300
34
2.3
35
85
6
101
74
4
8
12
1.21
8133221--8133301
35
2.3
35
78
4
92
75
4
8
11
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8140897--8143622
749
3.7
728
85
7
3328
34
15
13
36
1.87
8144119--8144167
17
2.8
16
79
14
53
26
32
0
40
1.56
8147533--8147698
35
4.8
34
78
10
174
32
25
12
29
1.92
8147535--8147698
70
2.3
70
88
0
238
32
26
11
29
1.91
8149291--8149456
35
4.7
35
80
8
169
31
25
12
30
1.93
8149293--8149456
70
2.3
70
88
2
231
31
25
12
30
1.92
8151614--8151854
120
2.0
120
99
0
473
38
24
18
18
1.93
8153548--8153642
47
2.1
45
80
7
104
33
22
27
16
1.95
8154371--8154420
18
2.7
18
79
14
57
22
4
0
74
0.99
8154364--8154445
27
2.8
28
82
15
80
21
7
0
70
1.11
8154578--8154622
3
14.7
3
82
13
56
28
2
2
66
1.15
8154581--8154614
16
2.1
16
94
0
59
29
2
0
67
1.05
8158863--8158903
16
2.5
16
84
4
55
78
4
9
7
1.10
8160494--8160531
3
12.7
3
100
0
76
68
0
0
31
0.90
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30
7.8
30
93
1
375
25
47
3
24
1.67
8168581--8168816
61
3.9
60
93
2
393
25
47
3
24
1.67
8168581--8168816
92
2.6
90
91
3
393
25
47
3
24
1.67
8169346--8169467
25
5.0
25
70
10
74
36
4
3
56
1.35
8169489--8169547
25
2.5
24
78
10
68
33
8
6
50
1.59
8169505--8169553
25
2.0
25
91
0
80
34
8
6
51
1.57
8169533--8169588
19
2.8
20
75
8
60
32
7
5
55
1.50
8173594--8173738
73
2.0
71
97
2
272
23
23
8
44
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8178025--8178191
71
2.4
71
89
4
259
29
14
21
34
1.93
8178077--8178428
114
2.9
122
81
12
424
28
14
19
37
1.91
8178334--8178965
75
8.5
74
80
12
640
30
16
20
33
1.94
8178678--8178705
14
2.0
14
100
0
56
14
21
7
57
1.61
8178623--8178781
85
1.9
85
85
7
225
28
18
19
33
1.95
8178692--8178965
73
3.8
74
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9
343
31
16
19
33
1.93
8178859--8179098
130
1.8
130
87
6
342
27
16
21
34
1.95
8178989--8179322
75
4.5
74
82
11
369
29
15
19
34
1.93
8179134--8179323
79
2.5
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8
218
30
14
18
35
1.91
8178701--8179434
356
2.1
349
91
6
1189
29
15
19
34
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362