Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  62  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
18906785--18906894
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4.2
26
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0
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137
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32
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26
3.2
26
96
0
150
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4
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137
2.0
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2.9
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206
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28
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24
17
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4.0
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22
24
16
35
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3.6
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177
24
22
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2.5
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200
26
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2.0
34
94
0
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20
23
22
33
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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28
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29
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14
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15
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6
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1.51
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19
2.0
19
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10
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16
2.1
15
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55
0
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1.9
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0
0
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2.0
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23
26
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31
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4
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2
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2
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66
1.18
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22
2.5
21
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0
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64
1.11
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2.4
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102
22
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8
60
1.54
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15
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24
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5.2
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34
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19008783--19008926
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2.7
54
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2
227
18
25
22
34
1.96
19008786--19008944
27
5.9
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73
20
91
20
25
20
33
1.97
19008786--19008944
81
2.0
79
81
10
189
20
25
20
33
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19015769--19015907
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5.2
26
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23
23
34
1.96
19015769--19015907
53
2.6
53
94
4
237
17
23
23
34
1.96
19015769--19015925
27
5.9
26
84
12
155
19
24
21
34
1.97
19019217--19019271
25
2.3
23
78
12
58
43
3
16
36
1.65
19019361--19019400
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1.9
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60
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2.5
25
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2.5
29
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30
1.43
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3
5
35
1.38
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2.5
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5
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148
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16
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1.34
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1.94
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18
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1.94
19034311--19034378
25
2.9
24
82
6
77
58
5
5
29
1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19034393--19034523
25
5.5
24
73
13
85
54
3
6
35
1.42
19034275--19034446
77
2.2
81
80
5
190
58
4
6
31
1.42
19035006--19035134
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0
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19
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1.72
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29
0
1
68
1.00
19042732--19042783
16
3.4
15
84
10
70
28
0
1
69
0.99
19042822--19042945
13
8.9
13
68
23
58
30
4
0
63
1.20
19042862--19042898
14
2.7
14
87
4
58
29
2
0
67
1.04
19042975--19043388
99
4.2
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18
260
33
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2
57
1.36
19043069--19043508
99
4.4
98
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17
264
35
5
2
56
1.35
19043181--19043328
5
29.8
5
66
18
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33
5
0
60
1.25
19043182--19043261
38
2.0
41
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7
139
35
5
0
60
1.19
19042914--19043505
300
2.0
301
98
1
1143
34
5
2
57
1.34
19043488--19043539
26
2.0
26
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32
0
5
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1.20
19043834--19043908
30
2.4
32
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13
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22
9
8
60
1.54
19046957--19047024
34
2.0
34
100
0
136
38
5
38
17
1.74
19049492--19049543
24
2.2
24
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0
95
48
3
0
48
1.20
19049961--19050008
19
2.5
20
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25
4
4
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1.27
19049979--19050022
19
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20
0
4
75
0.98
19054614--19054722
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2.9
37
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2
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27
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1.97
19054864--19055248
48
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48
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0
635
29
27
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1.83
19058862--19059418
40
13.7
40
88
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25
29
22
23
1.99
19058862--19059420
82
6.8
82
96
0
1023
25
28
22
23
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19060701--19060842
37
3.9
37
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2
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28
32
14
24
1.94
19060723--19060842
37
3.3
37
92
1
206
27
34
15
23
1.94
19060995--19061323
48
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48
94
0
559
31
26
6
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1.82
19065426--19065459
16
2.1
16
100
0
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17
17
11
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28
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28
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0
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1.80
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228
2.1
228
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24
1.99
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15
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0
0
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68
3
0
28
1.04
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15
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0
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2
0
37
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2.0
29
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0
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3
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22
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1.94
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45
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28
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24
1.99
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17
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50
76
5
0
17
0.98
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0
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6.0
90
90
0
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27
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1
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39
20
22
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19133081--19133170
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2.1
43
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10
2
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19133104--19133195
43
2.2
42
81
14
109
58
9
2
29
1.42
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
19140256--19140426
45
3.9
45
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26
29
22
22
1.99
19143106--19143143
14
2.5
15
87
8
51
50
7
2
39
1.46
19156931--19156991
31
2.0
31
87
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88
50
0
11
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1.39
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2.2
48
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9
130
30
21
22
25
1.99
19157810--19157892
23
3.7
23
90
1
123
31
21
19
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1.9
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51
0
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15
2.0
15
93
0
51
6
10
10
73
1.25

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362