Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  254  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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86010813--86010847
17
2.1
17
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54
22
0
8
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1
34
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
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2.0
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7
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30
0
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1.28
86042500--86042550
20
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19
84
12
59
31
0
7
60
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.98
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2.1
40
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4
98
22
27
15
34
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86131906--86132035
46
2.8
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194
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23
14
26
1.94
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4.1
40
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181
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28
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59
1
0
38
1.08
86144507--86144578
26
2.6
27
82
6
83
54
2
0
43
1.15
86160747--86160780
15
2.2
16
94
5
61
61
17
8
11
1.54
86168858--86168923
33
2.0
33
96
0
123
30
16
15
37
1.90
86183044--86183269
40
5.7
40
83
4
226
24
21
28
25
1.99
86195707--86195740
17
2.0
17
88
0
50
70
0
0
29
0.87
86196990--86197017
14
2.0
14
100
0
56
42
0
14
42
1.45
86197995--86198024
14
2.1
14
93
0
51
50
10
0
40
1.36
86209366--86209812
47
9.5
47
95
0
768
29
29
8
32
1.87
86219480--86219573
48
2.0
48
87
8
138
19
12
27
40
1.88
86221992--86222085
48
2.0
48
87
8
138
19
12
27
40
1.88
86222373--86222471
27
3.7
27
85
4
121
41
21
6
31
1.77
86222924--86223055
27
5.0
27
82
6
117
37
19
11
31
1.87
86222903--86223082
80
2.3
79
79
7
177
37
20
12
29
1.89
86223043--86223259
27
8.0
27
86
0
281
34
18
21
25
1.96
86223011--86223245
81
2.9
81
84
4
298
34
17
19
28
1.95
86223462--86223556
25
3.8
25
92
0
154
26
25
23
25
2.00
86223462--86223569
25
4.4
25
86
8
109
28
23
23
25
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86231846--86231883
17
2.1
19
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14
53
50
5
2
42
1.39
86237665--86237696
13
2.5
13
94
0
55
59
0
3
37
1.13
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14
2.3
14
94
0
55
81
3
12
3
0.93
86237765--86237795
14
2.3
14
94
5
55
74
3
22
0
0.96
86241475--86241503
13
2.1
14
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51
48
0
0
51
1.00
86241568--86241626
30
2.0
30
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6
84
49
11
6
32
1.66
86257099--86257133
19
1.9
19
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11
56
22
14
0
62
1.31
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3
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3
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0
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0
0
68
0.90
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18
2.1
17
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5
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2
27
1.39
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17
1.9
17
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0
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18
3
24
54
1.57
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3
10.0
3
100
0
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0
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0
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0.92
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5.4
9
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0
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34
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18
1.75
86267017--86267056
18
2.2
18
95
0
71
35
5
42
17
1.71
86267913--86267972
26
2.3
25
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11
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65
1
6
26
1.27
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23
2.0
23
100
0
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0
17
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1.47
86271512--86271559
21
2.3
21
85
0
60
29
37
16
16
1.91
86271739--86271857
59
2.0
58
79
12
127
27
13
11
47
1.78
86272209--86272240
5
6.6
5
92
7
57
81
0
0
18
0.70
86272210--86272240
9
3.3
9
95
4
53
80
0
0
19
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29
2.0
29
92
0
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31
28
12
28
1.93
86282467--86282492
13
2.0
13
100
0
52
38
38
15
7
1.76
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26
2.0
26
88
7
77
34
0
4
62
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
86287465--86287498
16
2.1
16
94
0
59
20
41
11
26
1.87
86288389--86288609
27
8.2
26
86
6
280
35
22
24
17
1.95
86288389--86288609
54
4.1
54
92
1
354
35
22
24
17
1.95
86289264--86289423
26
6.2
26
96
0
293
35
26
6
30
1.83
86293024--86293169
40
3.7
40
83
7
172
23
22
27
26
2.00
86293031--86293202
80
2.2
79
81
7
188
26
20
26
26
1.99
86297817--86298036
54
4.1
54
91
1
316
35
21
25
18
1.95
86297817--86298036
27
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26
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242
35
21
25
18
1.95
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3.2
26
94
0
146
36
25
6
31
1.81
86301701--86301755
20
2.7
21
81
13
71
63
1
7
27
1.31

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362