Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  340  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Score
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26
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0
0
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
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2.5
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115
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1
16
51
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
43
91
0
140
23
23
21
30
1.99
113205697--113205730
11
3.1
11
84
16
52
73
0
5
20
1.04
113205877--113205926
26
1.9
26
83
0
64
56
2
0
42
1.11
113205864--113205912
19
2.6
18
81
9
53
63
2
0
34
1.06
113209715--113209788
29
2.6
28
78
6
85
35
4
1
59
1.25
113212815--113212852
20
1.9
20
88
0
58
42
5
0
52
1.24
113218040--113218104
30
2.2
29
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10
78
32
9
12
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1.73
113218240--113218327
31
2.9
31
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39
14
11
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1.82
113219399--113219502
49
2.1
49
85
3
138
28
25
22
24
1.99
113219413--113219518
49
2.2
49
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3
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29
23
21
25
1.99
113220436--113220493
30
1.9
30
89
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91
67
8
13
10
1.42
113220436--113220493
31
1.9
30
89
3
89
67
8
13
10
1.42
113221809--113221847
17
2.2
17
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30
10
17
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1.83
113233991--113234029
21
1.9
20
84
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51
53
2
5
38
1.37
113236312--113236383
29
2.4
29
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13
45
1.71
113237567--113237608
20
2.1
20
91
8
68
54
0
4
40
1.21
113245714--113245751
20
1.9
20
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2
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1.38
113248167--113248226
31
1.9
31
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0
84
38
13
11
36
1.81
113248889--113248927
19
2.2
17
86
9
51
12
7
2
76
1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
113250930--113250965
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1.9
19
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56
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8
0
69
1.15
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27
2.7
27
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21
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1
70
1.18
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95
2.0
95
91
0
306
27
23
20
28
1.99
113257283--113257335
6
8.5
6
75
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1
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100
0
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0
58
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2.1
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100
0
140
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0
0
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0
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5.6
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12
1.89
113275393--113275610
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2.8
78
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39
24
22
12
1.89
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3.4
21
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0
126
47
22
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15
1.82
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4.1
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4
88
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2.7
29
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48
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3
33
1.61
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17
2.3
17
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0
28
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1.03
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3.2
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0
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0
78
0.98
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2.1
50
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134
19
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10
18
27
1.82
113305297--113305334
13
2.8
13
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4
58
42
0
13
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23
6
1
68
1.22
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17
2.3
17
82
4
53
55
0
0
45
0.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
113316187--113316216
15
2.0
15
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0
51
13
13
16
56
1.67
113321795--113321819
2
12.5
2
100
0
50
0
52
0
48
1.00
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2.1
27
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0
105
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7
26
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9
5.4
9
80
10
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0
2
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2.1
21
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2
2
47
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2.3
19
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50
0
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30
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1.89
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0
1
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1.10
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8
6.7
9
74
21
61
43
0
1
55
1.10

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362