Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  335  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111677921--111678774
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146
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38
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1.20
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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C
G
T
Entropy
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2
53
1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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1
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2
34
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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0
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1.58
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18
2.1
18
90
0
58
81
7
0
10
0.87
111791447--111791557
54
2.1
54
96
0
204
41
18
12
27
1.86
111791556--111791739
99
1.9
98
90
1
296
37
17
18
26
1.93
111797191--111797357
35
4.6
35
84
8
194
34
24
10
31
1.89
111797186--111797357
75
2.4
73
83
10
219
34
23
10
31
1.89
111809085--111809121
16
2.3
16
90
0
56
18
54
24
2
1.57
111813271--111813335
29
2.2
29
78
10
71
47
9
3
40
1.51
111813423--111813448
5
5.2
5
100
0
52
19
0
38
42
1.51
111819536--111819582
23
2.1
22
88
11
69
53
2
0
44
1.12
111819646--111819672
11
2.5
11
100
0
54
88
0
11
0
0.50
111824454--111824487
17
1.9
18
94
5
61
23
0
8
67
1.18
111832460--111832516
29
2.0
28
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13
71
49
3
3
43
1.36
111835825--111835854
13
2.4
13
94
5
53
50
0
6
43
1.28
111835833--111835872
19
2.0
20
85
4
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50
2
2
45
1.28
111837060--111837113
17
3.1
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15
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68
3
1
25
1.16
111837060--111837114
18
3.1
17
78
21
60
69
3
1
25
1.15
111847680--111847754
20
3.8
20
86
6
93
40
9
16
34
1.80
111847804--111847939
52
2.7
51
92
5
224
27
22
22
26
1.99
111847804--111847939
26
5.3
26
87
3
190
27
22
22
26
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111852944--111852977
18
1.9
17
88
5
50
58
0
5
35
1.22
111861435--111861993
193
2.9
197
78
9
488
28
15
17
38
1.90
111861544--111861993
193
2.3
193
82
5
491
28
15
17
38
1.91
111863360--111863448
45
2.0
45
97
0
169
26
24
11
37
1.89
111864655--111864701
16
2.7
18
80
9
62
14
4
31
48
1.63
111866374--111866403
12
2.5
12
94
0
51
30
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30
23
1.96
111867746--111867783
16
2.4
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0
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31
0
0
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0.90
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2
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2
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0
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0
48
0
1.00
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18
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0
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16
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1.86
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3
10.0
3
100
0
60
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0
0
33
0.92
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21
2.5
20
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9
61
62
3
1
32
1.24
111896201--111896239
20
2.0
20
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5
53
61
0
0
38
0.96
111898200--111898236
18
2.1
18
94
0
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2
5
35
1.36
111898651--111898734
3
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3
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4
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27
1.34
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2.6
39
90
0
148
35
24
26
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1.92
111900958--111901022
21
3.2
21
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26
12
1.90
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15
2.1
15
100
0
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6
12
25
1.59
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2.0
210
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1
778
27
7
4
60
1.44
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3.0
39
78
16
108
38
1
2
57
1.22
111904922--111904982
11
5.2
11
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13
50
34
3
1
60
1.23
111904922--111905050
24
5.7
22
74
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115
34
3
3
58
1.29
111904894--111904974
36
2.2
38
86
6
112
35
2
2
59
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
111904896--111905045
46
3.5
41
78
18
148
35
2
3
58
1.28
111908094--111908140
22
2.0
24
84
8
62
57
2
12
27
1.47
111918966--111919006
17
2.6
15
78
14
55
63
0
0
36
0.95
111919039--111919095
29
2.0
28
83
10
71
66
3
1
28
1.18
111919055--111919093
21
1.9
21
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71
69
5
0
25
1.09
111936320--111936370
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3.0
17
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0
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70
0
0
29
0.87
111941900--111941990
45
2.0
45
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0
164
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2.1
112
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0
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22
24
1.99
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4.1
18
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0
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10
8
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1.70
111956665--111956781
47
2.5
47
90
2
173
42
22
18
16
1.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362