Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  195  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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1.81
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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T
Entropy
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20
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19
18
40
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.99
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349
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25
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1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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22
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25
2.00
65618003--65618058
28
2.0
28
96
0
103
26
17
0
55
1.43
65619542--65619574
10
3.3
10
95
0
57
51
9
12
27
1.69
65623859--65623911
17
3.4
17
67
20
51
15
28
32
24
1.95
65623858--65623934
30
2.6
30
97
0
145
15
31
31
22
1.95
65629935--65630112
48
3.7
48
79
4
189
24
28
20
25
1.99
65636072--65636145
25
3.0
25
79
0
85
29
22
16
31
1.96
65643841--65643882
21
2.0
21
85
0
57
26
16
38
19
1.92
65646113--65646172
30
2.0
30
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0
84
30
25
6
38
1.81
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3.6
61
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3
230
28
25
12
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1.92
65648130--65648234
32
3.4
32
63
15
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27
13
29
1.94
65648759--65648851
30
3.1
30
85
0
132
17
36
19
26
1.94
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131
1.9
131
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0
416
39
20
18
22
1.92
65659185--65659246
33
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32
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3
79
46
1
8
43
1.42
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22
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2
7
48
1.44
65660495--65660580
43
2.0
43
93
4
147
50
0
25
24
1.50
65660555--65660600
19
2.5
18
85
3
56
52
0
21
26
1.47
65665205--65665376
46
3.7
48
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9
207
26
19
30
23
1.98
65666688--65666860
46
3.7
46
79
11
201
21
20
28
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.8
93
92
2
290
21
20
29
28
1.98
65667085--65667122
19
2.0
20
85
15
53
36
0
23
39
1.55
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79
2.3
81
84
7
232
24
22
27
25
2.00
65669043--65669226
40
4.6
40
83
9
216
23
22
28
25
2.00
65669095--65669249
79
2.0
79
84
7
208
25
21
27
25
1.99
65681609--65681822
40
5.4
40
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2
265
22
28
22
26
1.99
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46
3.7
46
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208
21
20
27
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1.98
65688232--65688402
93
1.8
93
93
0
297
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21
28
28
1.98
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19
2.0
20
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36
0
23
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2.0
20
85
15
53
39
23
0
36
1.55
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3.7
46
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29
27
20
23
1.99
65712742--65712912
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1.8
93
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2
272
28
28
20
22
1.99
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3.1
45
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18
123
28
28
19
23
1.99
65717280--65717330
27
1.9
26
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4
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35
13
27
23
1.93
65717966--65718111
27
5.4
27
94
0
202
24
22
19
32
1.97
65721941--65722209
39
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39
91
0
421
22
26
28
23
1.99
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25
2.0
25
83
0
62
36
0
16
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1.47
65729649--65729689
22
1.9
21
85
14
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24
9
2
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1.37
65729794--65729824
11
2.8
11
100
0
62
25
9
0
64
1.24
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40
4.5
40
90
4
272
24
24
27
24
2.00
65742095--65742300
40
5.2
40
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0
351
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21
26
27
1.99
65750168--65750206
21
1.9
20
94
5
69
46
23
0
30
1.53
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
65750512--65750567
26
2.2
26
100
0
112
37
21
7
33
1.81
65755376--65755588
46
4.6
46
84
10
263
27
29
22
21
1.99
65755422--65755592
93
1.8
93
93
0
297
27
28
22
21
1.99
65757685--65757746
31
2.0
30
84
3
79
29
24
6
40
1.80
65764826--65765077
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44
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27
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17
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1.97
65764863--65765077
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2.3
90
82
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238
26
30
17
25
1.97
65775368--65775427
23
2.6
23
100
0
120
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49
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1.99
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24
2.3
24
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32
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5.6
40
80
5
213
33
25
16
24
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362