Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  22  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6584247--6584340
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4.1
23
85
0
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0
0
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0
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2.9
30
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8
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8
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1.57
6591208--6591246
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1.9
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0
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1.09
6594391--6594428
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2.2
17
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9
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60
0
2
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1.11
6596923--6597007
20
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2
5
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1.30
6596922--6596977
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64
0
7
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17
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1
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1.29
6596939--6596995
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3.1
18
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1
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26
1.28
6597448--6597628
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2.1
88
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235
38
7
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40
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2.4
248
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1
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15
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2.4
93
91
0
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32
11
20
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1.89
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33
6.5
33
79
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221
32
11
21
35
1.89
6613076--6613275
93
2.1
93
93
0
337
32
11
21
36
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6613178--6613315
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2.1
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5
163
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10
21
31
1.88
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7
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12
54
11
2
0
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0.66
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15
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10
55
12
2
0
85
0.70
6615951--6615999
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2.3
20
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12
2
0
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24
2.0
24
100
0
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33
37
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25
1.75
6628267--6628407
25
5.7
24
81
8
140
19
28
19
32
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6628274--6628420
75
2.0
75
82
5
181
20
27
19
33
1.96
6630616--6630653
20
1.9
20
84
10
51
42
13
23
21
1.88
6632548--6632775
46
5.0
46
91
1
332
39
14
23
22
1.91
6634155--6634203
14
3.3
14
81
15
62
65
0
2
32
1.04
6641286--6641315
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6
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0
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100
0
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0
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21
2.0
21
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19
2
51
1.59
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24
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69
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3
41
1.29
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33
2.3
33
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89
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2
2
30
1.21
6656253--6656298
23
2.0
23
84
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15
19
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1.93
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30
1.9
30
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100
20
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6672300--6672337
20
2.0
20
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5
60
23
7
5
63
1.42
6678893--6678951
23
2.6
23
83
2
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10
11
3
74
1.18
6679054--6679108
26
2.1
26
96
0
101
25
27
12
34
1.92
6682565--6684232
832
2.0
832
97
0
3131
32
17
19
30
1.95
6684599--6684629
16
1.9
16
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0
53
22
0
3
74
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20
2.0
20
89
5
60
26
7
2
63
1.35
6688520--6688648
30
4.3
30
96
0
231
25
50
6
17
1.69
6689125--6689332
23
8.6
25
70
14
87
32
6
4
56
1.44
6689219--6689324
25
4.0
28
68
20
77
29
6
4
59
1.43
6689269--6689335
25
2.9
22
78
10
71
29
5
5
58
1.46
6689398--6689453
25
2.3
24
79
14
62
37
16
3
42
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6711489--6711869
96
4.0
96
81
11
426
25
16
18
39
1.91
6711526--6711880
187
1.9
191
85
6
506
25
16
19
38
1.93
6711786--6712394
75
8.3
75
86
4
821
30
16
19
33
1.94
6711786--6712394
147
4.1
147
89
3
811
30
16
19
33
1.94
6711806--6712394
220
2.7
221
93
2
956
30
16
20
32
1.95
6712465--6712497
14
2.4
14
94
0
57
18
12
6
63
1.48
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90
3.9
88
81
8
363
29
17
17
35
1.93
6712300--6712653
182
2.0
179
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428
29
17
17
35
1.93
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103
1.8
104
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4
278
28
15
15
39
1.89
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87
2.4
87
82
4
236
30
13
18
36
1.90
6713544--6713597
18
3.3
18
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28
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50
7
20
1.73
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30
3.3
30
95
0
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50
6
18
1.69
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15
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6
4
56
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6714258--6714319
25
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11
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30
4
6
58
1.44
6714166--6714322
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1
190
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7
4
57
1.47
6714382--6714437
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0
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0
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30
4
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60
1.39
6728115--6728170
20
2.7
21
80
5
60
32
3
5
58
1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6728974--6729004
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0
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32
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115
54
2
0
42
1.15
6729250--6729370
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12.9
10
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14
71
54
0
4
40
1.25
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19
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19
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5
69
51
1
5
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1.33
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0
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0
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0
0
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19
79
5
70
7
9
3
78
1.06
6732003--6732086
26
3.2
25
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14
89
5
11
4
77
1.10
6731989--6732061
37
1.9
38
88
2
112
8
13
4
73
1.20
6732000--6732135
62
2.2
63
84
9
172
8
10
5
75
1.17
6732100--6732156
27
2.1
27
96
0
105
12
7
5
75
1.17
6732103--6732155
15
3.7
15
80
14
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13
7
5
73
1.23
6732151--6732225
23
3.3
23
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14
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42
0
1
56
1.08
6732186--6732228
21
1.9
23
86
13
63
46
0
0
53
1.00
6732175--6732260
36
2.5
35
78
12
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1
3
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1.25
6732185--6732263
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40
1
2
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1.21
6739762--6739821
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29
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25
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25
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1
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1.61
6741635--6741674
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2.2
17
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0
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0
0.81
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3
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3
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0
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0
66
0.92
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6
5.5
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0
66
18
18
15
48
1.81
6742726--6742764
18
2.2
18
90
0
60
17
23
12
46
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6742903--6742939
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2.1
18
89
0
56
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10
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27
1.80
6742907--6742949
18
2.4
19
80
11
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46
9
13
30
1.75
6744388--6744433
15
3.0
15
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3
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50
36
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6
1.54
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15
2.5
17
84
7
50
48
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4
2
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13
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1
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22
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0
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0
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2
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0
10
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18
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2
2
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110
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3.2
206
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15
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22
3.0
22
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0
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0
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10
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12
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4.8
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27
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4.0
42
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28
13
27
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47
4.7
48
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9
201
28
13
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1.94
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13
3.2
13
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37
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20
2.1
20
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14
21
19
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1.87
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18
2.3
18
83
0
57
59
4
0
35
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6774114--6774145
14
2.3
14
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0
55
31
3
0
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1.08
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1.9
17
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1.51
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5
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5
100
0
58
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0
17
0
0.66
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10
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0
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13
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4.7
46
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1
312
39
15
24
21
1.91

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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