Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  241  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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T
Entropy
(0-2)
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205
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Indices
Period
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Copy
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Score
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19
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1.37
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Percent
Indels
Score
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1.70
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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21
2.0
21
100
0
86
37
9
18
34
1.83
81718472--81718674
40
5.2
40
89
5
290
23
22
28
25
1.99
81718472--81718674
78
2.6
79
88
6
279
23
22
28
25
1.99
81726776--81726939
40
4.2
40
89
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228
24
22
28
25
2.00
81726776--81726939
79
2.1
79
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228
24
22
28
25
2.00
81733753--81733777
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2.1
12
100
0
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20
1.97
81741328--81741352
12
2.1
12
100
0
50
16
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16
60
1.58
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1.98
81748875--81748932
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5.2
11
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20
41
1.79
81748859--81748932
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2.2
34
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0
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20
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1.78
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43
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1.92
81762910--81763111
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3.7
54
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5
201
37
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1.94
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1.93
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4.6
46
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1.98
81771752--81771786
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17
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5
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81773285--81773495
46
4.6
47
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9
215
26
19
29
24
1.98
81773288--81773457
94
1.8
92
87
6
254
26
19
30
24
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.95
81777908--81777974
24
2.7
25
75
11
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37
17
22
22
1.94
81777934--81778074
24
5.7
24
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15
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20
26
19
1.96
81781711--81781790
7
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7
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1
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81781711--81781790
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2.0
21
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0
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0
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28
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24
25
2.00
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1.97
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22
1.96
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1.98
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1.97
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13
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2
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0
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2
0
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1.8
127
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16
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2.1
26
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0
110
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2.0
26
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1.92
81824018--81824073
26
2.2
26
96
0
103
30
7
25
37
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
81835932--81836109
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4.5
40
90
3
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23
24
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24
1.99
81837798--81838520
178
4.1
178
88
0
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26
27
1.98
81837889--81838175
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1.97
81838067--81838506
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10.0
44
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186
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16
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27
1.97
81837814--81838605
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174
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1.98
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1.96
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1.97
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2.3
16
95
0
65
5
21
21
51
1.68

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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