Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  305  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102433609--102433753
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1.8
138
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1.96
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2.2
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2.0
23
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2
0
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1.09
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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T
Entropy
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0
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0.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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20
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30
3
1
63
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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17
17
39
1.92
102575994--102576627
73
8.6
74
86
3
875
31
15
20
32
1.94
102575974--102576624
148
4.4
148
93
0
1034
30
15
19
33
1.93
102575993--102576624
295
2.1
296
90
0
1032
31
15
20
32
1.94
102576730--102576762
14
2.4
14
90
10
50
21
12
6
60
1.53
102576565--102577073
92
5.6
91
77
9
295
29
15
17
37
1.90
102576583--102576920
184
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180
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29
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17
35
1.92
102576672--102577073
92
4.4
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10
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30
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102576858--102577177
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102577797--102577852
18
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18
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25
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19
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102577787--102577872
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0
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5
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3
54
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102578416--102578561
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22
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102578715--102578766
8
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1.23
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0
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15
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6
4.2
6
100
0
50
16
0
16
68
1.22
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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0
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0
48
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51
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32
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1.63
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29
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0
3
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1.14
102607304--102607389
14
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0
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1.14
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0
0
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0
4
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0
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0
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25
21
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0
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1.8
99
81
0
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0
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15
2.0
17
88
11
50
43
31
0
25
1.55
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
102653989--102654073
21
3.9
22
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7
75
16
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24
37
1.93
102653999--102654059
21
2.8
21
80
5
77
14
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34
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2.0
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0
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11
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2.2
104
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369
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18
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31
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102656618--102656669
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2.0
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0
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2
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23
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3.2
33
90
0
151
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8
17
1.79

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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