Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  361  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119226812--119226883
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192
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2
0
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1.16
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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C
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T
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2.0
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44
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2.3
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315
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3
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18
20
30
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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2.0
29
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3
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1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.35
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25
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32
6
0
61
1.22
119501272--119501325
16
3.2
16
84
12
56
35
7
0
57
1.27
119518353--119518409
20
2.9
19
80
15
55
63
1
1
33
1.15
119520315--119520371
29
2.0
28
89
3
87
49
7
12
31
1.67
119526302--119526342
3
13.0
3
85
10
55
65
0
0
34
0.93
119529551--119529600
17
2.7
20
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10
0
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46
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119534180--119534229
17
2.7
20
78
18
70
10
0
44
46
1.37
119535515--119535558
23
2.0
23
90
4
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38
9
6
45
1.63
119535818--119535863
17
2.6
18
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13
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26
2
2
69
1.11
119538041--119538102
31
2.0
31
100
0
124
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0
3
51
1.17
119538092--119538117
12
2.2
12
100
0
52
53
7
0
38
1.30
119541166--119541204
17
2.3
17
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0
69
51
25
10
12
1.71
119546853--119547038
73
2.5
73
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0
363
27
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24
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1.80
119547655--119547686
13
2.5
13
94
0
55
31
0
12
56
1.37
119547781--119548022
50
4.7
50
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4
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26
24
29
19
1.99
119547781--119548030
100
2.4
103
88
6
364
26
24
29
20
1.99
119554780--119554811
13
2.5
13
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0
55
31
0
12
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1.37
119554906--119555147
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4.7
50
86
4
297
26
24
29
19
1.99
119554906--119555155
100
2.4
103
88
6
364
26
24
29
20
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119560742--119560839
23
4.3
23
88
2
153
31
25
21
21
1.98
119560749--119560837
45
2.0
45
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0
151
31
25
22
20
1.98
119563279--119563313
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11.7
3
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0
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0
0
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42
2.0
42
100
0
168
28
14
16
40
1.88
119574618--119574687
22
3.3
22
70
22
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28
14
15
41
1.86
119581152--119581196
14
3.1
14
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12
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4
0
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1.17
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2
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0
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0
0
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1.00
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20
0
0
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0.72
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2.1
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42
3
6
48
1.43
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2.2
19
83
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30
4
14
50
1.63
119598517--119598580
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3.4
19
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1
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26
1.25
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10
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1
1
74
1.01
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35
2.0
36
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7
85
31
2
5
59
1.35
119598781--119598851
36
2.0
36
83
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30
2
5
60
1.34
119598966--119599146
88
2.1
86
82
7
222
35
5
13
44
1.67
119599522--119599551
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5.0
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100
0
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0
0
16
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200
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17
8
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2.0
27
100
0
110
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7
20
1.60
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182
2.0
182
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1
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23
11
23
1.87
119617043--119617072
15
2.0
15
93
0
51
50
0
10
40
1.36
119617096--119617143
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10
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25
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2
66
1.26
119617642--119617683
19
2.3
18
84
12
50
28
11
4
54
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119634772--119634812
22
1.9
21
85
14
57
68
4
4
21
1.28
119636560--119636652
18
5.2
18
85
0
132
29
23
15
32
1.95
119646526--119646742
111
2.0
109
95
4
395
24
32
9
34
1.87
119653174--119653313
75
1.9
76
83
1
183
38
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17
22
1.93
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2.0
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0
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0
0
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2.2
23
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70
47
0
9
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1.36
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2.0
20
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5
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1.48
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2.0
27
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3
1
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1.30
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3.1
26
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83
56
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11
27
1.54
119666777--119667322
73
7.5
72
81
3
509
36
14
20
27
1.92

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362