Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  360  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
118952661--118952992
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21
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21
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1.98
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4.3
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276
30
21
21
26
1.98
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1.9
216
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563
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26
1.99
118954286--118954348
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25
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1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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0
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2.4
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2.1
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0
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36
1.83
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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103
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Indices
Period
Size
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Number
Consensus
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Score
A
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(0-2)
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5
1.26
119095482--119095515
17
2.0
17
94
0
59
44
50
0
5
1.26
119095556--119095830
150
1.8
150
88
0
415
27
30
17
24
1.97
119096686--119096724
20
1.9
20
89
5
60
71
2
2
23
1.10
119099086--119099110
7
3.6
7
100
0
50
0
56
0
44
0.99
119099655--119099688
16
2.2
15
89
5
50
2
29
0
67
1.05
119099655--119099688
15
2.2
16
89
5
52
2
29
0
67
1.05
119099661--119099703
18
2.4
18
84
3
52
0
23
0
76
0.78
119099817--119099884
30
2.2
31
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7
95
20
7
20
51
1.71
119106982--119107010
2
14.5
2
100
0
58
51
0
48
0
1.00
119111743--119111875
60
2.2
62
82
8
166
44
6
1
47
1.38
119120083--119120162
21
3.7
22
75
8
67
22
10
11
56
1.64
119120394--119120445
15
3.2
15
73
19
50
44
0
1
53
1.11
119120814--119120854
18
2.2
19
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21
4
9
63
1.44
119121979--119122347
188
2.0
187
85
2
499
32
11
14
40
1.83
119125299--119125332
17
2.0
17
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0
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0
5
1.26
119129938--119129971
17
2.0
17
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0
59
44
50
0
5
1.26
119130554--119130611
22
2.6
20
77
20
53
44
0
5
50
1.24
119133230--119133372
42
3.1
42
64
27
101
46
4
23
25
1.70
119133193--119133386
96
2.0
96
98
0
379
44
5
24
25
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119133570--119133951
42
9.1
41
80
4
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29
23
28
18
1.98
119133612--119133895
126
2.3
125
86
3
383
28
24
29
17
1.97
119133660--119133931
126
2.2
126
85
4
352
29
25
26
18
1.98
119141214--119141377
42
3.7
42
84
8
186
28
26
14
30
1.95
119141284--119141389
49
2.2
48
91
3
167
31
26
13
29
1.94
119142746--119142853
44
2.4
44
87
3
144
29
23
13
33
1.93
119149829--119149956
44
2.8
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80
7
134
34
14
24
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1.93
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5
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80
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0
1
55
1.10
119155813--119155870
8
6.7
9
74
21
61
43
0
1
55
1.10
119155815--119155870
12
4.5
12
81
16
69
42
0
1
55
1.10
119157178--119157216
18
2.1
19
90
4
62
41
0
10
48
1.37
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39
3.4
39
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112
23
20
28
28
1.99
119157712--119157752
19
2.2
19
87
12
59
46
0
24
29
1.53
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2.3
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120
30
21
12
35
1.90
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31
2.8
31
92
0
147
26
28
19
25
1.99
119160028--119160156
50
2.5
51
92
2
215
25
21
17
35
1.95
119161550--119161576
13
2.1
13
100
0
54
55
7
14
22
1.64
119164031--119164066
18
2.0
18
88
0
54
55
5
2
36
1.38
119164217--119164333
59
2.0
59
96
0
216
48
14
5
30
1.68
119169730--119169770
20
2.0
20
100
0
82
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4
14
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1.66
119175206--119175246
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2.0
21
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51
0
0
48
1.00
119178694--119178965
141
1.9
141
94
0
481
27
23
26
22
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
119179369--119179414
3
15.3
3
81
0
56
30
63
4
2
1.26
119185260--119185304
21
2.1
21
84
8
56
53
4
11
31
1.56
119188013--119188057
20
2.4
18
81
7
54
51
0
0
48
1.00
119188271--119188329
29
2.0
29
87
9
84
23
11
6
57
1.58
119202979--119203083
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2.2
46
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8
147
35
1
6
56
1.37
119203058--119203082
13
1.9
13
100
0
50
40
0
8
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1.31
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143
2.0
143
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0
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1.81
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0
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2
2
63
1.22
119206109--119206169
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20.3
3
93
0
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1
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0
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1.02
119216310--119216357
24
1.9
26
87
8
73
0
4
31
64
1.12

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362