Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  298  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100036702--100036756
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20
1.94
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Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
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18
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24
27
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
Indels
Score
A
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26
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247
26
17
28
26
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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52
8
11
27
1.66
100314142--100314228
26
3.3
26
79
10
72
51
6
0
41
1.28
100316749--100316832
21
4.1
21
66
23
54
8
23
1
66
1.26
100326919--100326950
16
2.0
16
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0
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37
21
12
28
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100329298--100329322
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4.2
6
100
0
50
0
16
20
64
1.30
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29
2.0
29
100
0
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23
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23
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0
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36
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26
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100339920--100339976
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2.1
27
100
0
114
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10
7
40
1.66
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2.0
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0
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32
1.68
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22
2.5
21
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20
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1
5
39
1.37
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100379122--100379170
25
2.0
25
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16
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1.87
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0
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3
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2
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10.0
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2
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1.11
100382675--100382726
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53
1
0
44
1.11
100383523--100383573
27
1.9
26
84
11
68
27
3
17
50
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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15
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0
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1.79
100387685--100387728
5
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5
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0
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40
20
31
6
1.79
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21
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0
70
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38
2.1
38
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18
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0
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66
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9
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29
2
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1.72
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2
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20.4
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0
2
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0
0
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2
0
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1.82
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2.0
23
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17
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17
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2
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20
1.17
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4.2
26
92
0
180
29
6
26
37
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
100441308--100441347
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2.2
19
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27
25
2.00
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6
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0
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0
0
16
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2.2
17
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26
0
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24
2.4
24
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22
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204
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2.1
14
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51
55
10
0
34
1.34

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362