Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  219  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74000042--74000094
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1
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1.97
74019281--74019571
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126
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2
175
32
25
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1.92
74064477--74064605
57
2.3
57
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2
188
32
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28
1.92
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12.8
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2.0
682
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20
35
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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1.98
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1.97
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84
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25
18
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1.54
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10
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1.96
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269
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19
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1.97
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2.4
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91
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10
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74175527--74175787
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3.2
80
81
6
278
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9
21
38
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.3
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0
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1.93
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0
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1.57
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2.1
17
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20
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1.96
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19
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1
3
43
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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250
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0
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1.45
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125
2.0
125
100
0
502
20
27
24
27
1.99
74251986--74252210
3
72.0
3
69
11
82
58
2
8
30
1.41
74251984--74252087
46
2.3
46
79
8
117
58
0
8
32
1.28
74252544--74252625
3
27.7
3
73
11
71
63
2
4
29
1.28
74254362--74254398
18
2.1
18
89
0
56
72
5
8
13
1.24
74254381--74254625
77
3.2
74
82
4
260
33
20
18
28
1.96
74254381--74254621
75
3.2
77
81
7
287
32
20
18
28
1.96
74254528--74254800
89
3.1
87
78
10
284
36
19
16
27
1.93
74254528--74254789
91
2.9
88
78
10
271
35
20
16
27
1.94
74263159--74263194
4
9.0
4
87
0
54
50
2
22
25
1.63
74266794--74266819
13
2.0
13
100
0
52
84
0
0
15
0.62
74267196--74267415
3
70.0
3
70
11
79
57
2
9
30
1.42
74267664--74267754
18
4.9
17
74
23
60
58
1
8
31
1.36
74267709--74267784
3
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3
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10
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59
2
7
30
1.40
74267689--74267784
9
10.2
9
71
8
57
57
2
8
32
1.40
74267737--74267796
30
2.0
30
87
6
86
63
3
5
28
1.31
74278274--74278383
48
2.3
48
87
3
168
32
10
10
47
1.70
74278831--74278898
18
3.8
18
75
11
50
8
32
35
23
1.86
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74278841--74278898
12
4.8
12
81
8
64
6
32
37
22
1.81
74281355--74281379
12
2.1
12
100
0
50
64
0
0
36
0.94
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31
1.9
31
93
0
102
20
30
25
25
1.99
74282585--74282631
3
15.7
3
95
0
85
0
34
0
65
0.93
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154
2.5
147
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7
455
45
4
8
41
1.54
74298566--74298612
24
1.9
24
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12
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31
6
6
55
1.51
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100
0
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0
0
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0
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0
2
32
1.04
74301945--74302007
3
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0
3
26
1.03
74301962--74302008
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2.5
19
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6
60
74
0
2
23
0.93
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12.2
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14
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20
16
31
1.95
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4.0
76
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11
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29
1.95
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148
5.8
146
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9
941
30
20
16
32
1.95
74302921--74303200
71
3.8
76
86
7
366
30
21
16
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1.95
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284
2.9
283
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1227
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20
16
32
1.95
74302781--74303410
213
3.0
209
80
11
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29
21
16
32
1.95
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26
2.5
22
72
20
55
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6
6
17
1.34
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3
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3
68
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59
1
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30
1.37
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12
7.7
12
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57
2
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29
1.46
74316174--74316336
24
7.0
23
67
12
82
59
1
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29
1.37
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12
2.2
12
100
0
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59
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14
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1.58
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7
8.0
7
80
11
62
64
1
1
32
1.14
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
74316596--74316641
3
15.3
3
86
0
65
63
2
4
30
1.26
74317574--74317607
12
2.6
13
86
13
52
41
38
5
14
1.70
74318387--74318444
24
2.4
25
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13
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29
6
0
63
1.20
74318743--74318784
22
1.9
22
85
0
57
21
7
2
69
1.25
74322786--74322814
9
3.3
9
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24
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1.86
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49
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2
441
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33
1.85
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27
3.3
27
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1.79
74330446--74330708
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1.85
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44
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1
111
30
22
23
24
1.99
74335314--74335421
44
2.5
43
80
4
119
41
25
14
18
1.88

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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