Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  326  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
108993114--108993274
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79
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0
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2.0
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5
0
45
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1.25
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35
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2.0
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0
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2.0
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2.5
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3.6
25
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4
121
35
23
17
24
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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58
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2.1
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0
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1.26
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50
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26
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2.1
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2.0
212
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0
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28
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28
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21
21
1.99
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3.7
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87
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1.58
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1.8
93
96
0
315
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28
21
21
1.99
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3.7
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210
28
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21
21
1.99
109108845--109108934
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2.1
42
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0
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28
13
15
42
1.85
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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21
21
1.98
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46
3.7
46
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13
210
21
21
27
28
1.99
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1.8
93
96
0
315
21
21
28
28
1.99
109122179--109122300
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2.7
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0
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25
1.98
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132
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0
2020
26
24
18
31
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
24
18
31
1.98
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2.4
205
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0
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29
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19
30
1.97
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1.9
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86
6
178
36
14
16
33
1.89
109162450--109162496
19
2.5
20
89
6
71
42
8
21
27
1.81
109165251--109165344
3
31.3
3
72
19
65
67
1
3
28
1.13
109165251--109165334
12
6.8
12
77
16
75
65
1
3
29
1.17
109165256--109165315
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3.2
18
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63
1
3
31
1.20
109165734--109165833
22
4.4
22
72
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8
0
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1.30
109165741--109165846
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7
0
54
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1.29
109165736--109165848
35
3.2
35
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0
199
7
0
55
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1.27
109165741--109165846
48
2.2
48
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133
7
0
54
37
1.29
109165754--109165852
22
4.3
22
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14
92
7
0
56
36
1.27
109165928--109165972
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15
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2.0
22
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0
81
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13
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1.75
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138
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138
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1.90
109175749--109176017
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109177837--109177895
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11
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0
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109191324--109191394
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18
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0
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109191342--109191386
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6
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109191342--109191396
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9
12
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1.64
109191416--109191497
42
2.0
42
85
4
112
25
4
13
56
1.57
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109191406--109191495
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12
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5
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1.58
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48
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0
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1.87
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3.4
38
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2
202
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5
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2.2
21
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0
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18
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31
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1.35
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0
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1.41
109215231--109215275
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2.1
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1.33
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0
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0
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0
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1.33
109215265--109215662
48
8.3
48
85
7
535
24
13
0
61
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
109215288--109215711
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75
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0
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2.0
133
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0
0
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0
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0
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0
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0
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0
33
1.05

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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