Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  310  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103783507--103783558
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0
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2
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2.4
31
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13
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2
27
1.23
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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2
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1.9
123
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20
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23
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0
31
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
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Score
A
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(0-2)
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0
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21
2.1
21
87
12
63
62
0
0
37
0.95
103891690--103891743
23
2.3
24
78
9
58
53
5
0
40
1.24
103891835--103891897
26
2.4
27
81
10
76
46
1
3
49
1.27
103892041--103892104
21
3.0
21
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20
60
48
0
0
51
1.00
103892041--103892101
23
2.7
22
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9
70
49
0
0
50
1.00
103892362--103892430
23
3.0
23
78
6
68
60
0
0
39
0.97
103892447--103892519
36
2.0
36
85
15
98
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4
5
21
1.27
103892442--103892493
18
2.9
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74
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1
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26
1.18
103892535--103892576
9
4.8
9
94
5
77
83
0
7
9
0.81
103892535--103892576
17
2.4
18
96
4
77
83
0
7
9
0.81
103916057--103916100
20
2.1
21
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4
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11
0
27
1.30
103916840--103916902
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2.1
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0
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21
4.0
23
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1.92
103921619--103921676
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0
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5
86
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58
2
0
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2.1
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0
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3
0
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16
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0
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5
0
34
1.21
103923297--103923343
19
2.3
22
79
17
57
38
12
4
44
1.62
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103927705--103927763
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3.4
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73
11
57
66
0
3
30
1.08
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19
3.7
19
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5
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39
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34
1.81
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2.1
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1.93
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30
3.0
30
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4
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0
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204
2.8
204
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2
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3.0
30
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4
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1.36
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0
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18
20
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2.1
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0
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160
42
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17
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1.89
103960642--103960666
12
2.1
12
100
0
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24
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1.91
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1.85
103968372--103968479
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2.1
52
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3
182
35
23
8
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1.85
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5.3
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16
26
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2.6
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240
30
26
16
27
1.96
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22
2.2
22
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2
0
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2.0
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55
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51
1.44
103974990--103975036
3
15.7
3
100
0
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68
0
0
31
0.90
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11
1.60
103976316--103976354
14
2.7
14
84
4
51
41
41
0
17
1.50
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103976336--103976408
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2.6
28
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41
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2
24
1.69
103976433--103976486
14
3.9
14
82
0
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44
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1
22
1.63
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40
4.1
40
82
0
195
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20
21
32
1.98
103976924--103977088
80
2.1
80
86
2
224
25
20
21
32
1.98
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53
0
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2.5
43
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144
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1.96
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0
4
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1.22
103994750--103994813
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0
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1.22
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100
0
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0
0
30
0.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362