Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  236  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79752435--79752539
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32
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1.97
79752455--79752522
23
3.0
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75
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22
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1.97
79755190--79755233
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2.4
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0
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0
0
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1.81
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201
41
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2.1
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1.95
79809956--79810119
54
3.0
54
90
2
249
18
23
21
36
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.99
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26
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6
208
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23
23
36
1.94
79821276--79821442
54
3.1
54
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2
255
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23
36
1.94
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1.98
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22
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2.0
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20
88
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4.5
106
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531
35
16
24
23
1.95
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3.0
160
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23
1.95
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4.9
48
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7
258
29
25
19
25
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
0
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11
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0
5
11
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19
2.1
19
86
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55
78
0
7
14
0.96
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16
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14
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1
0
53
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
79949150--79949230
28
2.8
28
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5
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44
2
0
53
1.14
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11
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2
0
48
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53
1.57
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21
1.9
21
85
10
55
35
15
17
32
1.91
79971358--79971405
20
2.3
21
79
17
55
6
22
33
37
1.80
79971380--79971423
20
2.2
20
87
0
61
6
22
34
36
1.81
79971376--79971415
20
2.0
20
95
0
71
5
22
35
37
1.76
79973442--79973467
11
2.4
11
100
0
52
50
11
19
19
1.77
79977965--79978200
48
4.9
48
95
0
391
34
6
28
30
1.83
79978336--79978487
74
2.1
74
93
0
259
27
18
28
25
1.98
79978347--79978491
37
3.9
37
89
3
220
26
19
28
25
1.99
79979540--79979944
109
3.7
109
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3
427
34
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14
24
1.94
79984232--79984268
15
2.3
17
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13
60
62
0
0
37
0.96
80001786--80001815
16
1.9
15
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51
23
13
30
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1.93
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14
2.9
14
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0
53
32
7
17
42
1.77
80003359--80003425
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100
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10
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1.77
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20
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12
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1.77
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3.0
21
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16
27
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1.89
80014526--80014572
23
2.0
23
88
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8
1.52
80014641--80014695
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2.3
24
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14
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29
23
0
47
1.52
80015445--80015486
22
1.9
22
90
0
66
9
11
2
76
1.12
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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10
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12
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60
1
0
38
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3
17.7
3
85
14
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64
1
0
33
1.05
80015495--80015547
19
3.1
17
85
15
74
64
1
0
33
1.05
80017600--80017631
12
2.6
13
85
14
50
31
0
3
65
1.08
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49
4.9
50
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2
271
26
19
26
28
1.98
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24
2.5
24
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0
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6
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11
1.67
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0
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1.97
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24
25
23
2.00
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2.6
31
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1.41
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15
2.0
16
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6
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0
51
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1.44
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1.8
93
93
0
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27
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21
1.99
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3.8
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207
28
28
21
21
1.98
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9
75
9
112
32
0
20
46
1.56
80039813--80039940
57
2.2
57
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0
166
32
0
20
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1.56
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2.8
241
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0
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19
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56
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25
2
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1.63
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2.4
28
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7
82
25
0
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50
1.49
80046429--80046491
21
3.0
21
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2
54
25
0
23
50
1.49
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41
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2
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16
23
33
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80046780--80047072
122
2.4
122
82
2
347
25
15
23
34
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
80048428--80048476
22
2.2
22
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0
80
36
24
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30
1.85
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12
2.7
12
90
0
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12
18
25
1.85
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12
2.1
12
100
0
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0
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1.02
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18
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0
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66
1
18
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30
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2
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1
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19
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2
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1.30
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29
1.95
80074562--80074762
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26
14
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27
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223
26
15
29
29
1.96
80082664--80082867
54
3.8
54
84
3
257
25
15
29
29
1.96

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362