Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  32  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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26
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0
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1
49
1.11
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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19
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101
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9
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1.85
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33
2.2
33
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108
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19
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28
1.80
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16
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28
1.98
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48
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12
244
25
28
17
28
1.98
9550593--9550631
17
2.3
17
100
0
78
43
10
10
35
1.73
9551497--9551540
19
2.3
19
100
0
88
4
31
13
50
1.62
9551940--9551984
19
2.4
19
100
0
90
33
8
6
51
1.59
9552947--9552987
20
2.1
19
86
4
55
19
39
24
17
1.92
9562788--9562922
50
2.7
50
94
0
225
28
34
20
16
1.94
9566963--9567091
17
7.4
17
65
28
51
32
4
0
62
1.21
9584235--9584411
46
3.8
46
92
0
264
21
19
27
31
1.97
9585904--9586122
46
4.7
46
81
9
248
20
20
29
29
1.97
9585946--9586022
20
3.5
20
68
21
64
18
22
31
28
1.97
9586015--9586094
26
3.3
26
66
20
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21
30
27
21
1.98
9595157--9595244
40
2.3
39
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7
108
35
36
11
17
1.85
9596108--9596183
38
2.0
38
92
0
125
36
17
28
17
1.92
9599780--9599844
26
2.5
26
85
7
80
38
20
18
23
1.93
9599883--9600070
65
2.9
65
81
1
227
33
22
21
22
1.97
9600989--9601049
30
2.0
30
81
12
72
19
19
0
60
1.36
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9602048--9602080
17
1.9
17
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0
57
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0
3
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1.16
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50
2.0
50
97
0
189
45
23
11
20
1.82
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31
2.4
31
80
11
80
45
4
4
45
1.41
9620417--9620511
47
2.0
47
87
4
138
29
5
22
43
1.75
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19
2.6
19
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24
2
6
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1.24
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15
2.0
15
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0
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10
0
60
1.30
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2.5
129
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2
482
29
17
18
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1.94
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2.4
12
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0
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0
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2.1
13
100
0
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29
0
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1.58
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3.2
32
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29
17
12
40
1.87
9630150--9630331
64
2.8
64
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0
310
29
17
14
38
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2.2
88
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6
236
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21
22
24
1.98
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44
13.8
44
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29
23
20
27
1.99
9630710--9631307
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6.8
88
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1
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28
23
20
27
1.99
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30
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23
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1.98
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89
2.7
89
87
0
332
28
19
24
27
1.99
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227
1.9
221
82
4
525
29
18
23
28
1.98
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45
3.7
45
79
6
165
30
18
22
27
1.97
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89
2.3
89
84
3
233
32
18
21
28
1.97
9631332--9632292
316
3.1
315
83
6
1131
30
18
22
28
1.97
9634167--9634495
130
2.6
130
89
2
486
28
16
20
35
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9635594--9635694
47
2.1
47
88
0
148
35
22
13
27
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
9636597--9636633
16
2.2
17
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4
58
72
0
21
5
1.04
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129
2.0
129
97
0
493
38
8
30
23
1.85
9639722--9639773
25
2.1
25
100
0
104
44
15
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4.2
26
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7
119
26
23
21
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1.99
9654068--9654180
55
2.1
55
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3
129
16
26
29
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2.0
24
91
0
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10
4
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9
100
34
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1.95
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133
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19
20
30
1.97
9661315--9661359
22
2.0
22
82
0
54
22
0
33
44
1.53

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362