Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  352  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
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2
59
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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64
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1
59
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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43
1.61
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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33
1.74
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15
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15
83
4
51
17
0
7
74
1.05
116655954--116655983
15
1.9
16
93
6
53
16
0
3
80
0.85
116665989--116666050
32
1.9
32
93
0
106
45
9
11
33
1.73
116666810--116666846
15
2.4
16
86
13
60
32
0
0
67
0.91
116674277--116674325
25
2.2
20
82
17
53
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2
4
30
1.24
116683522--116683561
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0
2
85
0.71
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3
12.0
3
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68
0
0
31
0.90
116688615--116688644
14
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15
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0
0
60
0.97
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43
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43
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2
317
33
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3
55
1.43
116696590--116696657
15
4.5
15
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2
2
60
1.27
116696480--116696703
88
2.6
85
87
4
306
33
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3
55
1.43
116697181--116697236
22
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24
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5
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25
3
8
62
1.41
116698189--116698329
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2.0
70
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0
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14
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1.86
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2.0
33
100
0
132
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0
73
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50
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2
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31
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254
27
19
27
24
1.99
116714073--116714244
93
1.8
93
91
4
285
27
19
27
24
1.99
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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3.5
47
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28
13
27
29
1.95
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46
5.0
46
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1
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21
24
15
38
1.92
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2.3
30
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84
27
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2.2
23
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0
102
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29
1.34
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3
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1.38
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18
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0
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1.30
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2.0
22
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0
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51
0
0
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0
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6
24
1.39
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24
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1.36
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15
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0
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20
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79
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23
22
23
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1.99
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22
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1.99
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1
27.0
1
100
0
54
0
0
0
100
0.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
116751222--116751277
26
2.1
27
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3
105
32
12
28
26
1.93
116757865--116758288
44
9.8
43
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13
212
30
19
22
27
1.98
116757910--116758366
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5.3
85
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12
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30
19
21
28
1.97
116757909--116758420
175
3.0
175
87
2
725
30
18
22
28
1.97
116758441--116758516
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3.5
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2.6
44
94
0
194
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13
22
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1.93
116757909--116758494
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3.4
173
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1.97
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1.92
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1.9
30
85
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80
28
26
5
40
1.77

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362