Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  28  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8179548--8179954
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8179758--8179954
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2.8
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276
29
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15
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2.0
17
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15
0
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1.45
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.5
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8214712--8214768
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2.2
26
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21
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2.0
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3
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0
0
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147
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172
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1.94
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16
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1.94
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222
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63
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1.34
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3.7
100
84
7
428
37
20
18
24
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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87
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1.95
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2.3
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15
4.1
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52
57
1
4
36
1.30
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5.6
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73
13
100
55
3
5
35
1.38
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3.3
18
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1.73
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1.65
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0
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3
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2.1
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19
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2.2
31
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0
111
43
5
11
39
1.65
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
8315189--8315306
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1.9
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2
10
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106
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19
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1.66
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2.1
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0
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12
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0
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5
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0
0
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0
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2.2
23
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0
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0
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Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
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G
T
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17
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2.0
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23
2.2
24
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0
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0
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0.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
0
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82
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378
20
25
20
33
1.97

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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