Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  308  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0.59
103247514--103247548
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0
0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Percent
Indels
Score
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42
1.87
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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16
22
22
39
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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1.97
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0
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69
1.07
103388005--103388102
49
2.0
49
95
0
178
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12
24
1.73
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14
2.9
14
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0
55
43
7
17
31
1.76
103389468--103389524
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2.1
27
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6
107
47
12
7
33
1.68
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15
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15
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19
50
44
0
1
53
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103390004--103390047
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2.0
22
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0
0
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0
0
56
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2.0
13
100
0
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15
0
0
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17
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15
0
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103393747--103394060
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20
23
14
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2.0
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0
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4
34
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103399845--103399893
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22
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22
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3
0
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2.0
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0
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2.0
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0
0
38
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2.0
20
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50
0
0
50
1.00
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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1.8
93
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20
21
1.98
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3.8
46
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28
19
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1.98
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20
2.0
20
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0
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24
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4
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22
25
20
31
1.98
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24
2.9
24
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1.96
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0
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0
0
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1.9
22
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1.55
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19
1.58
103477049--103477095
22
2.2
21
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3
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59
8
12
19
1.58
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21
2.1
21
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4
72
56
0
11
31
1.35
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2.0
26
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0
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3
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32
1.50
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10
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10
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13
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2
8
22
1.26
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8
6.8
8
73
23
51
53
0
1
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1.11
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20
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3
44
1.36
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17
1.9
17
93
6
57
56
0
6
37
1.25
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
103505382--103505443
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2.0
31
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0
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27
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1.80
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42
3.7
42
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8
186
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25
15
30
1.96
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4.7
47
82
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195
29
25
15
28
1.96
103515172--103515339
47
3.6
47
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3
169
29
26
16
27
1.97
103515131--103515339
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4.5
46
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7
212
29
25
16
28
1.97
103515131--103515339
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2.3
94
82
8
243
29
25
16
28
1.97
103515370--103515510
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4.5
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2
212
23
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1.98
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0
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0
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103522861--103522915
16
3.6
15
79
13
51
60
27
0
12
1.33

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
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          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
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          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362