Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  18  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5546938--5547096
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1
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2.3
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2.1
21
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0
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53
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0
2
50
1.15
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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7
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2.1
29
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18
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2
0
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1.14
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4
1
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0
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2.2
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5611579--5611642
29
2.3
29
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10
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1
29
1.17
5611597--5611641
23
2.0
23
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2
26
1.22
5623812--5623856
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2.5
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10
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4
0
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1.13
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2.2
22
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2
0
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5624460--5624501
22
2.0
22
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0
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0
0
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22
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1.15
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2.0
26
82
7
63
35
0
3
60
1.15
5639739--5639789
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2.9
19
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5
0
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5.0
18
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2
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13
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0
3
69
1.03
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59
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138
38
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1.9
30
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3
80
46
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12
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0
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0
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12
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50
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6
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5652795--5652850
27
2.1
27
83
6
69
46
16
3
33
1.64
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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33
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0
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53
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0
80
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15
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57
18
0
0
81
0.70
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2.0
51
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1.9
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21
1.96
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88
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35
20
21
22
1.96
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0
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12
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3
21
1.63
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5723831--5723894
22
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22
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23
1.65
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21
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21
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1.61
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1.66
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4.1
42
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16
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21
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252
26
19
27
26
1.99
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21
2.3
22
80
16
59
46
0
2
51
1.12
5727110--5727165
21
2.8
18
76
23
51
48
0
0
51
1.00
5729308--5729534
46
4.9
46
86
3
267
41
14
22
21
1.89
5729319--5729534
93
2.3
92
84
2
254
41
14
22
20
1.89
5731923--5732025
53
2.0
52
86
5
145
29
15
24
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1.96
5731936--5732050
53
2.3
50
82
10
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29
16
23
30
1.96
5731936--5732070
53
2.7
50
78
12
138
27
17
25
29
1.97
5733028--5733123
30
3.1
32
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13
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57
8
2
32
1.40
5733097--5733138
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2.0
22
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4
0
33
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5733417--5733483
28
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28
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1.30
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2.9
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58
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2
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1.28
5733544--5733674
23
5.7
23
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16
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58
3
2
35
1.29
5733609--5733678
11
6.1
11
74
9
50
58
4
0
37
1.18
5735217--5735263
25
2.0
25
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27
14
4
53
1.60
5735524--5735873
46
8.0
46
84
10
446
22
24
15
36
1.93
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5735524--5735873
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88
89
4
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22
24
15
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1.93
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38
4.0
38
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12
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25
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1.96
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2.5
32
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10
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3
1
40
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54
2.0
54
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1
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22
3
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2.0
17
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0
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2
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39
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1.98
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1.98
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2.4
134
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2
507
29
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28
1.98
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15
2.0
15
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20
6
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1.58
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50
2.4
51
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5
196
35
15
22
26
1.94
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2.0
31
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0
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1.98
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40
2.8
43
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9
131
23
23
25
26
2.00
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2.1
17
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0
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1.90
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2.7
46
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2
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28
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1.97
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2.0
22
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2.0
21
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0
84
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1.84
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36
2.1
36
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0
139
54
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22
1.67
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36
2.0
36
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110
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42
11
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2.0
36
89
0
110
46
10
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184
3.0
182
95
1
974
41
12
12
34
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5767588--5767687
43
2.4
42
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5
121
41
9
15
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1.78
5767629--5767924
139
2.1
140
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1
479
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11
12
34
1.79
5767773--5767870
36
2.6
37
83
9
110
44
10
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1.74
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2.0
36
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0
119
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9
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2.0
45
91
0
146
39
10
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1.81
5767287--5767870
184
3.2
179
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865
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12
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1.80
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2.0
21
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0
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1.76
5771645--5771684
18
2.2
18
86
8
55
47
10
10
32
1.70

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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