Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  355  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Indels
Score
A
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0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
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116
32
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7
52
1.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
117594488--117594533
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1
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24
2.5
25
82
10
67
49
0
1
49
1.10
117594497--117594545
24
2.0
24
88
8
71
48
0
2
48
1.12
117595001--117595053
22
2.5
21
77
19
56
30
1
0
67
1.01
117596427--117596461
18
2.0
18
88
5
54
68
0
11
20
1.20
117600682--117601044
180
2.0
181
92
2
602
34
18
14
31
1.91
117601775--117601810
16
2.2
16
90
9
56
69
16
11
2
1.29
117609647--117609783
30
4.8
28
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14
91
32
8
7
51
1.61
117609616--117609787
85
2.0
85
98
0
335
31
9
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52
1.60
117609708--117609739
10
3.3
10
95
4
57
31
6
0
62
1.20
117610446--117610483
17
2.1
19
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9
62
26
13
5
55
1.59
117611584--117611625
20
2.1
20
86
8
59
33
26
9
30
1.88
117612607--117612631
3
8.3
3
100
0
50
0
0
68
32
0.90
117614971--117615255
46
6.2
47
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4
339
20
21
14
43
1.87
117615005--117615079
24
3.2
24
60
17
57
18
22
16
42
1.88
117614941--117615223
92
3.1
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20
20
14
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117614964--117615256
138
2.1
139
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1
383
20
21
14
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1.87
117615231--117615282
27
1.9
27
92
0
86
21
23
15
40
1.91
117615185--117615328
73
2.0
73
98
0
279
22
24
14
38
1.92
117615139--117615357
119
1.8
119
96
0
402
24
25
13
36
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
117615255--117615357
46
2.2
46
94
0
188
24
26
13
35
1.92
117619396--117619451
27
2.1
27
89
0
85
37
8
17
35
1.82
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15
2.2
15
100
0
66
18
9
6
66
1.40
117623727--117623767
16
2.8
15
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10
50
39
0
0
60
0.96
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19
2.5
19
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13
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38
2
0
59
1.09
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22
2.1
22
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34
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14
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1.64
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1.74
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2.1
16
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0
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5
23
1.66
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28
1.44
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2.0
22
85
0
59
58
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11
18
1.63
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0
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56
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19
1.66
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2.2
22
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7
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60
6
16
16
1.55
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20
2.2
20
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4
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1.63
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15
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15
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0
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19
2.0
20
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5
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2
0
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1.12
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21
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4
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2.0
45
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130
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3
5
56
1.38
117668698--117668737
20
2.1
19
85
4
53
47
0
10
42
1.37
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20
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63
0
0
36
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15
3.2
15
77
14
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63
0
0
36
0.94
117670094--117670145
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0
0
38
0.96
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23
2.0
21
82
8
52
38
0
0
61
0.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
117674647--117674740
22
4.3
20
73
22
66
37
3
1
58
1.21
117677329--117677357
14
2.0
15
93
6
51
89
0
10
0
0.48
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2.1
107
94
1
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32
15
13
38
1.86
117681050--117681158
53
2.1
53
100
0
218
3
19
20
56
1.56
117681077--117681160
27
3.1
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180
2.5
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536
24
15
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1.92
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120
2.1
120
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2
310
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132
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17
27
27
27
1.98
117696080--117696560
252
1.9
252
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1
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17
28
27
26
1.98
117700495--117700546
22
2.3
22
90
3
77
32
1
15
50
1.55

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362