Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  275  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
92895163--92895298
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0
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1.19
92899329--92899413
10
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10
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17
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2
1
30
1.12
92899341--92899412
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20
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25
2.4
25
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2
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0
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1
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92900203--92900255
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23
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50
84
0
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19
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92922744--92922787
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52
18
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92924328--92924357
15
1.9
16
93
6
53
73
6
13
6
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
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2.1
13
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0
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16
2.1
16
100
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17
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2.0
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20
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2.1
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86
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10
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26
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5.0
132
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31
17
23
26
1.97
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220
2.2
220
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777
31
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2.1
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12
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43
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205
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3.8
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198
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1.8
93
92
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29
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2.1
37
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115
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18
30
25
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0
0
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58
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0
1
75
0.88
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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0
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0
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15
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47
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23
1.63
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2.1
17
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0
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1.98
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134
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1.36
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2.6
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1.30
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58.0
3
67
14
58
58
3
6
31
1.41
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93005608--93005657
21
2.4
21
83
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57
60
2
2
36
1.20
93006164--93006188
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1.9
13
100
0
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32
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1.36
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26
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25
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30
1.83
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34
2.4
35
84
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98
37
6
14
42
1.70
93017835--93018144
46
6.9
46
86
7
415
22
23
14
39
1.91
93017835--93018144
91
3.5
91
88
4
420
22
23
14
39
1.91
93017835--93018144
137
2.3
130
87
6
417
22
23
14
39
1.91
93018059--93018132
38
1.9
38
100
0
148
22
25
18
32
1.97
93020267--93020314
11
4.2
11
79
10
51
62
2
0
35
1.07
93021245--93021306
22
2.9
22
83
11
67
48
22
0
29
1.51
93021744--93021843
42
2.4
42
85
6
139
22
1
34
43
1.60
93021820--93021893
7
10.4
7
77
8
62
17
1
36
44
1.57
93021827--93021886
21
2.8
22
80
7
79
18
1
35
45
1.60
93021781--93021904
49
2.5
48
87
7
169
16
1
35
45
1.58
93022197--93022424
84
2.7
84
85
3
273
31
16
22
29
1.96
93022224--93022424
84
2.4
84
88
0
303
33
16
21
27
1.95
93022784--93022816
16
2.1
16
94
0
57
15
12
15
57
1.65
93024773--93024879
50
2.1
51
82
5
128
36
10
6
46
1.64
93025299--93025338
3
13.0
3
94
5
71
0
0
32
67
0.91
93025763--93025792
13
2.3
13
100
0
60
53
10
0
36
1.35
93025794--93025858
9
7.2
9
75
6
60
44
20
3
32
1.67
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93031000--93031028
14
2.1
14
93
6
51
34
0
6
58
1.25
93031729--93031810
31
2.5
33
78
7
96
14
4
19
60
1.51
93033875--93033910
15
2.5
14
86
8
54
33
16
11
38
1.84
93037090--93037166
9
7.8
10
75
16
54
31
1
1
66
1.08
93037101--93037154
20
2.7
19
75
16
56
29
1
1
66
1.12
93037679--93037727
25
1.9
26
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4
73
75
20
2
2
1.00
93038885--93038929
21
2.1
21
100
0
90
40
28
11
20
1.86
93045057--93046100
132
7.9
132
92
0
1683
28
18
25
28
1.98
93045343--93045793
45
10.2
45
65
11
153
28
17
25
27
1.98
93046469--93046516
24
2.0
25
87
4
71
75
20
2
2
1.02
93048967--93049420
131
3.5
131
89
1
626
29
19
17
33
1.95
93051862--93052037
46
3.8
45
78
12
196
21
19
28
30
1.98
93051859--93052029
93
1.8
93
93
0
297
21
20
28
29
1.98
93059426--93059587
46
3.5
46
77
14
188
20
20
30
29
1.97
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21
2.5
19
86
6
62
36
6
0
57
1.24
93063067--93063117
19
2.5
21
84
6
70
37
7
0
54
1.29
93066651--93066677
5
5.4
5
100
0
54
59
0
0
40
0.98
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150
2.0
150
96
1
563
37
17
7
36
1.79
93075458--93075499
2
21.0
2
100
0
84
50
0
50
0
1.00
93080538--93080576
15
2.6
15
79
0
51
7
25
2
64
1.33
93100036--93100101
15
4.4
14
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11
51
7
19
1
71
1.18
93106173--93106234
30
2.1
30
82
11
74
59
0
19
20
1.38
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
93112849--93112903
19
2.8
19
74
15
58
63
3
0
32
1.12
93117091--93117116
11
2.4
11
100
0
52
15
7
7
69
1.35
93119029--93119061
18
1.9
17
88
11
50
48
0
21
30
1.50
93120761--93120985
40
5.7
40
85
5
287
24
21
28
25
1.99
93120761--93121018
119
2.2
119
80
6
274
25
21
27
25
1.99
93197695--93198141
47
9.6
47
83
10
537
29
30
8
31
1.87
93197689--93198141
94
4.9
95
85
9
621
29
30
8
31
1.87
93197689--93198140
181
2.4
189
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8
635
29
30
8
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1.88
93201046--93201442
47
8.6
46
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7
567
29
30
6
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1.83
93207679--93208040
47
7.6
47
89
4
539
29
30
7
33
1.85

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
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          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
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          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362