Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  20  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
5996978--5997041
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0
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0
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100
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0
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2
2
51
1.30
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
24
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8
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4
2
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1.34
6079183--6079240
23
2.5
24
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8
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3
1
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1.28
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19
3.1
19
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5
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2.9
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1.9
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70
2.1
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5
4
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12
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0
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2.0
71
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4.4
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85
0
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31
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0
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2.5
25
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19
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16
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0
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2
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1.11
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30
2.0
30
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3
82
39
12
5
43
1.64
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21
2.0
21
90
0
64
19
29
21
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.0
47
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3
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1.40
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0
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2.0
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1
10
30
1.38
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26
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0
11
30
1.40
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2
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23
23
24
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89
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23
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0
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1
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0
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6203933--6204008
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2
6
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3.0
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4
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22
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36
3
3
56
1.34
6222501--6222717
25
8.7
25
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17
103
32
6
4
56
1.45
6222691--6222749
23
2.8
20
72
16
57
32
6
5
55
1.48
6222873--6222916
8
5.5
8
84
10
54
31
0
2
65
1.05
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6222873--6222916
15
2.7
17
82
10
56
31
0
2
65
1.05
6222865--6222917
24
2.2
25
80
10
65
30
3
1
64
1.22
6227597--6227632
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4
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6
54
72
0
0
27
0.85
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3
47.0
3
66
5
65
58
2
8
29
1.43
6243583--6243651
25
2.7
25
84
8
77
60
0
10
28
1.29
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2.1
133
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1
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22
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28
1.97
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178
4.3
178
87
2
1003
28
22
17
31
1.97
6245443--6245537
45
2.1
44
82
7
120
34
23
12
29
1.92
6245512--6245608
44
2.2
45
82
14
121
27
22
17
31
1.97
6251694--6251830
65
2.2
62
82
11
154
31
8
17
43
1.78
6251945--6252226
41
6.9
41
91
2
370
19
19
28
32
1.96
6252893--6252927
15
2.3
15
90
9
54
25
0
22
51
1.48
6258125--6258261
65
2.2
62
82
11
154
31
8
17
43
1.78
6258376--6258657
41
6.9
41
91
2
370
19
19
28
32
1.96
6259325--6259359
15
2.3
15
90
9
54
25
0
22
51
1.48
6266924--6267056
3
43.7
3
66
5
61
60
2
8
29
1.38
6266925--6267036
13
8.9
12
71
16
68
60
1
8
28
1.37
6266929--6267051
25
4.8
27
75
17
84
60
2
8
28
1.40
6266930--6267051
37
3.2
39
72
20
103
59
2
9
28
1.40
6269894--6269992
50
2.0
50
89
0
153
40
12
17
30
1.86
6275194--6275238
13
3.3
14
77
22
51
60
0
4
35
1.17
6285413--6285466
22
2.5
23
79
11
60
14
25
3
55
1.56
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6286086--6286141
27
2.1
27
100
0
112
33
28
14
23
1.94
6286949--6287011
29
2.2
29
94
0
108
50
4
1
42
1.32
6309255--6309306
19
2.8
18
81
16
61
78
0
11
9
0.95
6310206--6310248
6
7.2
6
89
0
68
18
16
16
48
1.81
6311545--6311577
11
2.7
13
81
18
52
9
6
15
69
1.34
6315210--6315246
20
1.9
18
89
10
56
35
21
0
43
1.53
6317760--6317860
39
2.6
39
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1
141
38
25
23
11
1.89
6326297--6326333
2
18.5
2
100
0
74
48
0
0
51
1.00
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90
2.7
88
82
3
297
40
18
7
33
1.79
6327076--6327108
11
3.1
11
91
4
50
72
0
3
24
0.98
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21
2.2
21
88
7
69
27
2
4
65
1.22
6327388--6327477
29
3.2
28
74
14
87
35
1
1
62
1.10
6327399--6327477
19
4.3
18
70
9
61
37
1
0
60
1.05
6327387--6327501
25
4.4
25
73
12
79
32
0
1
65
1.09
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11
2.3
11
100
0
50
0
8
0
92
0.40
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22
2.9
22
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17
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32
3
0
64
1.09
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12
3.0
13
76
7
51
26
0
10
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1.27
6331669--6331777
50
2.2
51
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3
184
36
15
22
25
1.93
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46
9.8
46
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1
609
21
24
14
40
1.89
6332604--6333055
139
3.3
138
87
1
627
21
24
14
40
1.89
6332604--6333041
185
2.4
185
92
0
725
20
23
14
41
1.89
6335429--6335512
31
2.7
31
90
0
132
26
19
26
28
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6335530--6335700
47
3.6
46
83
5
164
28
16
25
29
1.97
6335581--6335706
49
2.6
48
88
3
175
28
14
26
30
1.95
6345466--6345570
43
2.4
43
80
0
129
38
23
11
26
1.89
6350903--6351000
48
2.0
48
100
0
196
35
25
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24
1.93
6352429--6352468
18
2.3
18
91
4
64
40
0
20
40
1.52
6355636--6355672
18
2.1
18
94
0
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27
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1.91
6359955--6359983
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13
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0
10
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3
100
0
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0
0
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38
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2
113
33
10
3
52
1.53
6371797--6371935
29
4.7
29
69
11
93
41
15
12
30
1.84

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362