Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  152  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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1.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
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Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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15
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
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Matches
Percent
Indels
Score
A
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Entropy
(0-2)
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23
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1.95
Indices
Period
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Copy
Number
Consensus
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Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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23
2.2
22
81
3
53
10
12
0
77
0.99
50306220--50306282
21
3.0
21
88
2
90
30
3
33
33
1.74
50312274--50312316
17
2.5
17
79
20
54
23
25
9
41
1.84
50312713--50312809
30
3.2
30
73
2
88
28
16
25
28
1.97
50313112--50313146
11
3.0
12
83
8
54
22
8
2
65
1.34
50318842--50318937
30
3.2
30
71
11
90
27
15
29
28
1.96
50321074--50321170
30
3.2
30
75
2
106
28
15
26
28
1.96
50321651--50321747
30
3.2
31
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5
101
27
28
15
27
1.96
50324612--50324694
30
2.7
30
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9
89
14
21
1
62
1.38
50324645--50324700
18
3.1
18
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5
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7
19
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69
1.27
50324670--50324694
12
2.1
12
100
0
50
8
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0
76
1.02
50324697--50324727
12
2.6
12
100
0
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25
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45
1.83
50324777--50324816
16
2.5
16
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0
53
5
12
2
80
0.98
50325730--50325768
18
2.3
17
86
8
53
12
7
5
74
1.20
50325746--50325791
23
1.9
24
91
8
76
13
6
6
73
1.22
50325747--50325791
12
3.7
12
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11
56
13
6
6
73
1.24
50325730--50325810
41
2.0
41
82
7
101
14
7
6
71
1.28
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
50327459--50327555
30
3.2
30
74
8
99
28
15
27
27
1.96
50329172--50329271
30
3.3
30
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2
103
31
16
26
27
1.96
50332799--50332881
30
2.8
30
70
7
87
26
16
28
27
1.97
50337511--50337542
12
2.7
12
95
0
55
25
18
12
43
1.85
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5
11.0
5
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20
55
3
17
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1.00
50337590--50337646
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3
17
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1.00
50337590--50337651
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3.0
21
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3
16
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1.03
50338573--50338633
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32
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11
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1.20
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2.0
33
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1.96
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1.9
32
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1
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6
1.15
50344200--50344265
33
2.0
33
82
8
80
33
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2.3
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0
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1.91
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30
3.2
30
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8
90
27
15
28
27
1.96
50357530--50357576
20
2.3
20
85
0
67
21
12
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29
1.91
50359245--50359350
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2.2
48
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9
137
14
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11
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2.1
29
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13
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4
15
4
75
1.14
50362046--50362092
20
2.3
20
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0
67
21
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1.91
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30
2.8
30
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1
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11.0
5
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17
55
5
17
0
77
0.95
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2.9
15
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3
70
6
15
0
77
0.97
50363281--50363350
16
4.4
16
77
13
74
4
18
1
75
1.04
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
50364253--50364292
19
2.2
18
86
8
55
15
7
2
75
1.14
50366028--50366124
30
3.2
30
71
8
90
27
15
28
27
1.96
50367245--50367310
32
2.1
32
100
0
132
27
27
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3.0
11
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26
5
0
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16
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2
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0
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0
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2
0.91
50378792--50378827
10
3.7
10
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7
56
83
5
8
2
0.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362