Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   

This is table  40  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11739318--11739391
28
2.6
26
74
16
67
58
0
0
41
0.98
11739421--11739470
13
3.2
16
70
18
52
48
0
0
52
1.00
11739479--11739528
15
3.1
16
74
20
50
54
0
0
46
1.00
11741419--11741481
30
2.1
30
90
0
99
55
11
3
30
1.50
11741842--11741920
41
1.9
41
82
5
97
41
11
21
25
1.86
11743215--11743303
45
2.0
45
97
0
169
23
13
25
37
1.92
11749392--11749483
25
3.6
25
74
10
80
30
20
27
21
1.98
11749392--11749501
50
2.2
50
83
4
132
30
20
25
22
1.98
11751448--11751560
56
2.0
56
96
0
208
19
20
19
40
1.91
11752011--11752059
8
6.0
8
79
11
55
28
0
0
71
0.86
11752011--11752059
16
3.0
17
79
8
66
28
0
0
71
0.86
11754448--11754485
18
2.2
18
85
4
51
68
0
2
28
1.03
11754818--11754871
18
3.1
18
87
10
69
25
7
3
62
1.38
11759382--11759424
11
3.9
11
100
0
86
27
27
0
44
1.55
11759383--11759431
22
2.2
22
92
0
80
24
30
2
42
1.66
11761219--11761256
18
2.1
18
95
0
67
23
26
10
39
1.87
11761669--11761726
25
2.3
24
83
13
73
43
1
1
53
1.21
11761661--11761735
25
2.7
27
70
11
64
44
1
2
52
1.23
11761661--11761736
26
2.8
28
73
13
77
43
1
2
52
1.23
11761747--11761808
9
6.6
9
75
17
63
33
3
1
61
1.22
11761706--11761863
86
1.8
86
95
0
289
37
3
5
54
1.38
11761834--11761863
9
3.4
9
90
9
53
36
0
0
63
0.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11761711--11761890
86
2.1
86
83
3
220
41
3
5
50
1.43
11764894--11765649
126
6.1
126
86
5
1008
30
16
16
36
1.91
11765233--11765593
113
3.1
113
77
13
374
30
17
16
35
1.92
11765107--11765593
239
2.1
238
87
1
690
30
17
16
36
1.92
11765346--11765651
125
2.4
125
89
2
454
33
17
13
35
1.89
11765901--11765952
16
3.2
16
91
0
77
28
0
34
36
1.58
11765933--11766027
45
2.1
44
86
1
127
34
5
26
33
1.79
11766189--11766223
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
11766147--11766219
27
2.7
27
76
8
76
52
2
0
45
1.15
11766336--11766370
18
2.0
17
88
5
52
54
0
0
45
0.99
11766108--11766382
147
1.9
149
95
1
500
46
3
2
47
1.35
11766438--11766490
16
3.4
17
73
21
53
56
0
0
43
0.99
11766364--11766550
60
3.1
59
66
13
157
49
6
2
41
1.42
11766316--11766610
119
2.5
120
93
2
495
50
4
2
43
1.35
11770530--11770586
23
2.5
23
80
8
62
52
3
1
42
1.28
11772907--11772934
13
2.2
13
100
0
56
46
7
25
21
1.76
11777552--11777585
17
2.0
17
88
11
52
82
5
2
8
0.93
11781660--11781702
20
2.1
21
91
4
70
2
18
0
79
0.85
11782322--11782354
17
2.0
17
94
5
59
36
15
0
48
1.45
11782635--11782958
46
7.0
47
89
3
403
21
23
14
40
1.90
11782635--11782958
138
2.4
137
87
3
445
21
23
14
40
1.90
11790947--11790980
8
4.2
8
96
0
59
0
14
0
85
0.60
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11791500--11791540
20
2.0
20
90
0
64
48
2
0
48
1.14
11796610--11796699
46
2.0
46
100
0
180
37
15
15
31
1.89
11797973--11798070
17
5.7
17
84
6
117
14
17
29
38
1.89
11797973--11798077
51
2.0
52
85
5
142
15
16
28
40
1.88
11800869--11800909
19
2.2
19
86
4
57
70
4
2
21
1.18
11800835--11800908
31
2.4
31
78
13
82
66
4
2
27
1.23
11806301--11806341
21
1.9
21
90
5
64
39
2
4
53
1.35
11806350--11806428
8
10.4
8
85
8
103
31
0
0
68
0.90
11806350--11806433
22
3.8
21
80
12
96
29
0
0
70
0.88
11806350--11806441
16
6.1
15
84
10
100
28
0
0
71
0.86
11806353--11806441
7
12.0
7
84
9
90
28
0
0
71
0.86
11806510--11806557
23
2.1
23
100
0
96
31
4
12
52
1.58
11806987--11807037
15
3.5
15
72
5
50
47
27
1
23
1.63
11807160--11807232
37
2.0
37
91
5
121
20
0
28
50
1.48
11807292--11807614
41
8.1
41
82
8
312
21
24
20
33
1.97
11807294--11807614
82
4.0
81
82
10
351
21
24
20
33
1.97
11807354--11807417
31
2.1
31
90
0
101
23
23
18
34
1.96
11807313--11807536
72
3.0
72
89
7
306
21
25
20
32
1.97
11807292--11807499
113
1.8
113
89
2
328
22
24
20
32
1.98
11813487--11813534
10
5.1
10
73
21
50
52
2
0
45
1.12
11813463--11813551
24
3.7
22
76
19
65
52
2
2
42
1.26
11813463--11813561
37
2.7
35
77
13
85
51
2
2
44
1.24
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11813480--11813534
26
2.0
28
86
6
78
54
1
0
43
1.10
11813487--11813561
38
2.0
37
84
2
96
48
2
1
48
1.24
11813590--11813652
15
4.1
15
76
15
74
44
0
1
53
1.10
11820027--11820056
14
2.1
15
93
6
53
56
13
0
30
1.37
11820181--11820234
27
2.0
27
86
13
76
40
7
3
48
1.49
11821006--11821046
21
1.9
22
85
14
59
39
0
0
60
0.96
11823147--11823193
23
2.0
23
95
0
85
38
19
12
29
1.89
11825604--11825707
53
2.0
53
94
0
181
33
19
17
29
1.94
11833952--11834011
17
3.4
17
71
15
50
50
5
0
45
1.23
11834592--11834640
10
5.1
9
80
9
53
30
2
4
63
1.24
11834976--11835020
21
2.1
21
84
8
56
53
2
2
42
1.25
11834983--11835043
21
3.0
20
81
13
70
47
0
1
50
1.10
11845437--11845496
3
19.3
3
81
6
66
33
3
1
61
1.22
11847914--11847955
22
1.9
22
95
0
75
42
14
7
35
1.73
11850472--11850497
5
5.2
5
100
0
52
19
0
0
80
0.71
11854020--11854073
24
2.2
24
83
0
63
33
12
12
40
1.82
11859686--11859715
15
2.0
15
93
0
51
36
3
0
60
1.14
11860869--11860899
16
1.9
16
93
0
53
74
6
9
9
1.23
11864919--11864943
11
2.3
11
100
0
50
52
0
16
32
1.44
11866144--11866224
36
2.2
36
84
6
101
38
6
2
53
1.40
11870905--11871003
23
4.3
23
85
5
112
32
20
22
25
1.98
11870899--11871063
68
2.3
69
83
7
190
32
19
22
25
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11870905--11871003
45
2.2
46
83
5
121
32
20
22
25
1.98
11870891--11871016
23
5.5
22
77
9
92
34
18
23
24
1.96
11872044--11872332
138
2.1
139
94
1
519
36
13
10
39
1.80
11873559--11873602
22
2.0
21
82
4
52
63
0
0
36
0.95
11873768--11873947
91
2.1
85
84
10
231
39
17
9
33
1.82
11879984--11880098
42
2.7
42
86
4
151
28
25
14
31
1.95
11880069--11880188
47
2.6
47
82
1
143
30
27
15
25
1.96
11880217--11880396
31
5.8
31
87
5
256
26
26
20
27
1.99
11880378--11880500
50
2.4
51
90
5
196
26
22
15
35
1.94
11889051--11889120
34
2.1
34
100
0
140
11
11
21
55
1.66
11897372--11897475
50
2.1
50
100
0
208
26
15
5
51
1.65
11898450--11898493
11
3.9
11
84
3
61
70
0
2
27
0.99
11899200--11899225
10
2.6
10
100
0
52
26
19
34
19
1.95
11911221--11911252
16
2.0
16
93
0
55
53
0
6
40
1.26
11930528--11930577
18
2.7
19
84
6
68
32
12
16
40
1.84
11930701--11930732
6
5.3
6
92
0
55
46
15
18
18
1.84
11931911--11932003
16
5.7
17
69
16
63
51
2
0
46
1.13
11931957--11932001
18
2.4
18
82
14
56
57
2
0
40
1.11
11934127--11934177
20
2.7
19
82
11
61
39
0
5
54
1.24
11936319--11936592
46
6.0
46
87
0
334
40
15
23
20
1.91
11936315--11936587
92
3.0
92
87
0
393
40
15
23
20
1.90
11936329--11936592
138
1.9
138
85
1
368
40
15
23
20
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
11938626--11938684
30
2.0
30
82
0
73
33
11
23
30
1.91
11939087--11939209
46
2.7
43
80
14
124
26
19
29
24
1.98
11949911--11949950
20
2.0
20
90
0
62
42
17
27
12
1.85
11963531--11963741
104
2.0
103
92
2
352
18
19
29
31
1.96
11963661--11963811
71
2.1
71
91
2
241
23
17
29
30
1.97
11968286--11968325
11
3.6
11
93
0
53
25
0
25
50
1.50
11968282--11968325
22
2.0
23
86
4
63
22
0
25
52
1.48
11970996--11971364
138
2.8
138
84
8
432
39
15
24
20
1.91
11971071--11971364
46
6.4
47
94
1
420
41
14
24
20
1.89
11971637--11971683
25
2.0
25
83
8
62
53
4
14
27
1.60

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362