Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09
Please cite: G. Benson, "Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences" Nucleic Acid Research(1999) Vol. 27, No. 2, pp. 573-580. Sequence: Gbar_A08 Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000 Length: 119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  341  of  362  ( 43380 repeats found )
Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
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Entropy
(0-2)
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48
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5
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18
37
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
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2.3
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25
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2.0
34
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22
24
1.97
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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2.0
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Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
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Percent
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Score
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23
75
21
56
33
7
1
56
1.39
113502256--113502297
22
1.9
22
85
9
59
66
2
2
28
1.16
113510437--113510497
31
1.9
30
87
9
86
37
1
1
59
1.17
113513439--113513540
25
4.4
23
73
23
72
53
5
1
38
1.36
113513959--113513992
12
2.8
12
81
0
50
55
8
0
35
1.31
113513959--113514001
8
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8
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55
9
0
34
1.32
113515716--113515756
17
2.5
17
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11
50
63
4
0
31
1.15
113516821--113516864
21
2.1
21
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0
0
36
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2.0
169
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639
49
14
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26
1.73
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2
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19
2.1
19
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0
53
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5
2
1.04
113539882--113539943
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25
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70
19
4
4
1.23
113540168--113540201
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2.3
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11
0
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1.10
113540168--113540215
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1.02
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12
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0
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1.77
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17
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72
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2
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30
17
20
31
1.95
113551037--113551599
147
3.8
147
90
3
812
30
17
20
31
1.95
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
113551037--113551599
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2.6
220
87
3
785
30
17
20
31
1.95
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14
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14
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0
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18
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1.48
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4.2
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80
9
364
27
15
19
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1.92
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27
2.4
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4
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0
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0
24
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0
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23
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19
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1.55
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6
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44
1.52
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2.0
22
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22
22
1.97
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21
2.6
22
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8
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46
0
3
50
1.18
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30
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1.40
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131
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464
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25
0
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0
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5
102
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26
19
23
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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4.0
46
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0
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22
1.92
113582052--113582278
92
2.4
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222
40
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23
21
1.90
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0
0
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2.0
26
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0
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0
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0
30
0.89

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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