Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  21  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6371694--6371956
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2.9
91
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5
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13
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6374238--6374287
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2.2
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2
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1.42
6375125--6375157
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2.1
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3
6
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22
2.8
22
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11
63
11
3
9
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1.14
6377617--6377669
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2.7
19
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3
0
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2.2
26
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2.7
20
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2
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28
2
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1.02
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2.2
24
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23
31
1.93
6409988--6410116
23
5.5
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15
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16
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24
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1.96
6412045--6412164
42
2.8
43
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28
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20
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1.99
6412045--6412204
85
1.9
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6
200
28
25
20
26
1.99
6413949--6414319
86
4.3
85
75
6
241
32
21
16
29
1.95
6413958--6414390
172
2.5
170
80
5
426
33
21
16
29
1.95
6413993--6414390
86
4.7
85
75
5
295
33
22
15
28
1.95
6419002--6419227
79
2.9
78
87
1
326
33
14
20
31
1.93
6420980--6421026
19
2.5
19
85
0
58
76
0
14
8
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6420988--6421040
20
2.7
19
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21
56
73
0
15
11
1.09
6420987--6421040
21
2.7
20
75
21
58
72
0
14
12
1.13
6422979--6423021
22
1.9
23
85
4
61
16
9
6
67
1.40
6423156--6423226
14
5.0
15
72
26
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53
0
2
43
1.15
6423316--6423454
71
2.0
72
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5
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2
2
46
1.26
6424416--6424489
9
7.6
9
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20
51
25
2
1
70
1.09
6424419--6424488
22
3.3
20
77
14
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25
2
1
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1.10
6425820--6425849
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10.0
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100
0
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0
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69
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0
29
1.18
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4.1
21
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17
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70
6
0
22
1.10
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15
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1
29
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2
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100
0
54
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0
0
48
1.00
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4.0
42
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25
14
30
1.95
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47
3.6
48
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188
30
26
15
27
1.96
6442813--6443022
47
4.6
46
81
6
185
30
25
15
29
1.96
6443498--6443534
20
1.9
20
88
5
58
40
0
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51
1.32
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46
90
0
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39
14
24
21
1.91
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92
3.6
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1
264
40
15
23
21
1.91
6446624--6446772
31
4.8
31
88
0
217
26
28
18
26
1.98
6446748--6446876
50
2.5
51
89
2
197
24
22
16
36
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6450800--6450840
21
2.0
21
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4
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58
9
4
26
1.50
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22
2.0
21
86
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59
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2
0
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1.06
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14
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14
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16
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13
10
1.30
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2.0
34
100
0
136
35
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14
41
1.77
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2.0
18
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5
63
54
0
0
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1.9
31
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3
38
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2.0
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0
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23
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10
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2.2
20
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0
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1.27
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2.0
21
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14
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2.0
15
100
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8
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2.0
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62
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5
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2.4
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0
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25
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48
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15
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138
24
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0
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0
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4.8
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270
32
0
20
46
1.54
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6506839--6506886
25
1.9
25
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62
27
0
18
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1.44
6506768--6506951
65
2.9
64
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4
257
29
0
22
47
1.56
6507018--6507221
59
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59
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0
327
52
7
5
34
1.52
6510203--6510243
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1.9
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55
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0
0
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0
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20
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10
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0
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1.11
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5.0
8
84
6
53
30
0
0
69
0.89
6516913--6516983
23
3.1
23
80
6
83
32
2
1
63
1.18
6517526--6517562
18
2.1
18
100
0
74
37
10
10
40
1.75
6523940--6524017
33
2.4
33
79
12
88
24
26
19
29
1.98
6527581--6527640
30
2.0
30
96
0
111
30
28
16
25
1.97
6531809--6531844
11
3.0
13
80
19
51
30
0
0
69
0.89
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22
2.0
23
90
4
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75
9
6
9
1.20
6532619--6532780
73
2.2
72
87
1
234
12
32
3
51
1.58
6535739--6535805
33
2.0
33
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0
116
25
13
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1.90
6535823--6535908
43
2.0
43
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154
30
10
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30
1.90
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17
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0
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0
0
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1.79
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8
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8
100
0
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0
59
0.98
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18
2.2
19
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2
2
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1.18
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11
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11
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7
56
0
0
13
86
0.58
6538159--6538194
16
2.2
16
95
0
63
0
0
13
86
0.58
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.4
15
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0
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2
0
33
1.08
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10
22.7
9
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16
80
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2
4
31
1.31
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19
5.2
19
69
11
58
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2
5
27
1.25
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29
2.9
29
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7
87
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2
3
29
1.24
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29
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28
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2
5
31
1.36
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3
4
30
1.31
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19
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3
8
24
1.38
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2.5
247
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15
17
34
1.91
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2.6
239
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0
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14
28
1.93
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4.7
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11
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1.90
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2.0
64
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32
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18
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5
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1.58
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93
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23
20
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28
1.99
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10
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10
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10
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2.0
96
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30
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5.4
18
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37
24
24
13
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6568238--6568302
21
3.2
21
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12
64
41
21
24
12
1.87
6568220--6568320
39
2.6
39
96
0
184
38
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24
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21
1.9
22
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57
36
14
4
43
1.67
6571573--6571681
5
21.6
5
71
15
82
74
1
3
20
1.07
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
6571573--6571650
27
2.8
28
82
9
97
74
1
2
21
1.01
6574661--6574694
17
1.9
18
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55
5
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26
1.58
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10
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2
8
20
1.23
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0
0
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6
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10
1.31
6577308--6577373
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19
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2
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23
4.1
23
85
0
134
47
4
25
22
1.69

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362