Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362   

This is table  282  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95141713--95141751
15
2.6
14
81
14
51
43
0
0
56
0.99
95141713--95141751
16
2.6
15
84
8
53
43
0
0
56
0.99
95150472--95150516
18
2.3
20
85
7
58
40
15
2
42
1.59
95150482--95150536
28
2.0
28
85
0
74
41
12
1
43
1.53
95150509--95150597
18
4.8
18
78
8
90
40
12
8
38
1.74
95150516--95150597
36
2.3
36
87
4
121
39
12
9
39
1.76
95150758--95150841
44
1.9
44
87
4
125
33
25
19
22
1.97
95152042--95152138
3
33.7
3
67
19
55
56
2
1
40
1.18
95152051--95152138
13
7.4
12
67
24
53
56
2
1
39
1.19
95152042--95152138
16
6.5
15
71
16
69
56
2
1
40
1.18
95152088--95152114
8
3.4
8
100
0
54
51
0
0
48
1.00
95152404--95152490
24
3.5
24
66
17
68
56
4
4
34
1.40
95152428--95152510
3
27.0
3
73
9
51
57
2
2
37
1.25
95152434--95152463
15
2.0
15
100
0
60
53
0
0
46
1.00
95152389--95152510
52
2.3
52
95
2
219
57
3
3
36
1.31
95152651--95152697
19
2.4
19
76
20
51
36
19
4
40
1.71
95153380--95153408
12
2.3
13
94
5
51
68
0
0
31
0.89
95155712--95155765
27
2.0
27
88
3
81
57
0
3
38
1.17
95155692--95155892
100
2.0
100
85
6
277
43
3
3
49
1.38
95155878--95155934
29
2.0
29
82
6
71
35
1
5
57
1.31
95158737--95158783
15
2.9
16
84
9
60
68
10
4
17
1.35
95158737--95158780
16
2.7
16
86
10
54
65
11
4
18
1.40
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95159360--95159405
15
3.1
14
84
12
56
67
0
0
32
0.91
95159357--95159405
16
3.2
16
82
11
66
67
0
0
32
0.91
95159356--95159407
20
2.6
21
84
6
63
67
0
0
32
0.91
95159711--95159744
16
2.1
16
88
0
50
32
2
32
32
1.73
95164670--95164715
16
2.9
17
78
12
53
45
0
17
36
1.49
95165261--95165316
28
2.0
28
100
0
112
25
25
32
17
1.97
95166296--95166357
25
2.5
25
86
2
81
16
25
24
33
1.95
95166296--95166378
24
3.5
22
79
15
76
16
26
24
32
1.96
95169369--95169399
16
1.9
16
93
0
53
54
3
0
41
1.16
95171628--95171674
24
1.9
25
83
12
62
42
10
4
42
1.59
95178107--95178133
8
3.4
8
100
0
54
25
37
11
25
1.89
95192273--95192299
14
1.9
14
100
0
54
66
7
14
11
1.43
95209617--95209662
24
2.0
23
86
4
65
28
2
21
47
1.62
95212346--95212383
20
1.9
20
94
0
67
23
13
42
21
1.88
95213918--95214365
224
2.0
224
95
0
797
25
14
16
43
1.86
95214918--95214965
25
1.9
26
87
8
73
39
0
2
58
1.10
95214918--95214958
12
3.3
13
76
10
50
41
0
2
56
1.13
95216761--95216904
71
2.0
71
100
0
288
32
5
18
43
1.73
95218792--95218842
26
2.0
26
92
0
84
33
9
33
23
1.88
95219384--95219443
32
1.9
32
82
3
77
50
0
26
23
1.50
95220354--95220470
58
2.0
58
100
0
234
47
13
27
11
1.78
95220354--95220447
31
3.2
31
61
11
79
50
12
25
11
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95220632--95222015
695
2.0
687
98
1
2653
22
27
13
37
1.91
95221998--95222234
90
2.6
90
95
1
413
21
26
13
37
1.91
95222905--95222946
21
2.0
22
86
13
61
28
16
19
35
1.93
95226802--95226872
33
2.2
33
84
5
90
12
4
46
36
1.62
95228150--95228219
35
2.0
35
86
5
97
52
12
5
28
1.62
95228990--95229086
31
3.1
31
92
3
158
39
8
18
34
1.81
95230819--95230857
19
2.0
20
95
5
71
0
25
0
74
0.82
95230817--95230864
11
4.5
11
80
17
57
0
25
2
72
0.95
95234742--95234767
12
2.2
12
100
0
52
42
26
15
15
1.87
95238128--95238173
8
6.1
8
80
14
62
60
0
0
39
0.97
95238128--95238173
13
3.3
13
85
14
65
60
0
0
39
0.97
95238130--95238168
16
2.4
16
95
0
69
58
0
0
41
0.98
95238722--95238792
29
2.4
31
76
17
80
39
2
9
47
1.51
95239799--95239853
25
2.0
25
83
13
65
58
12
7
21
1.59
95243449--95243499
20
2.5
20
90
0
75
11
29
37
21
1.89
95244028--95244064
13
2.8
13
91
4
56
54
18
0
27
1.44
95255660--95255724
21
3.2
21
73
20
66
41
26
23
9
1.84
95255649--95255742
39
2.4
39
92
0
152
38
25
24
11
1.89
95266903--95266941
20
2.0
20
85
10
53
48
0
0
51
1.00
95267421--95267458
17
2.2
18
85
4
51
44
23
0
31
1.54
95268635--95268811
81
2.2
80
87
1
246
25
19
18
36
1.95
95268969--95269103
69
2.0
69
94
2
236
35
24
5
34
1.80
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95270652--95270685
16
2.1
16
88
0
50
35
0
0
64
0.94
95283414--95283554
53
2.7
53
87
2
194
26
17
26
29
1.97
95290887--95291019
52
2.5
52
90
6
198
27
18
26
28
1.98
95292378--95292420
17
2.6
16
85
7
50
72
4
2
20
1.14
95292376--95292432
28
2.0
29
82
6
71
70
3
5
21
1.22
95294009--95294070
19
3.4
19
72
20
60
70
6
4
17
1.26
95301492--95301518
10
2.7
10
100
0
54
92
0
0
7
0.38
95311021--95311052
6
5.3
6
96
0
55
0
15
3
81
0.82
95317334--95317364
13
2.3
14
94
5
55
83
3
0
12
0.75
95322789--95322851
27
2.3
27
94
0
108
33
23
28
14
1.94
95324294--95324403
28
3.9
28
80
4
123
29
14
29
27
1.95
95326150--95326219
19
3.2
24
65
23
71
44
2
5
47
1.41
95326130--95326257
42
3.1
42
94
1
213
43
2
8
45
1.47
95326126--95326196
19
3.6
19
67
22
56
47
1
7
43
1.39
95328911--95328939
9
3.0
10
90
10
51
58
0
0
41
0.98
95329406--95329525
61
2.1
57
84
9
154
43
4
3
49
1.38
95335169--95335217
21
2.3
21
82
10
64
18
2
6
73
1.14
95337569--95338055
245
2.0
245
95
0
884
24
20
15
39
1.91
95348533--95348566
18
1.9
18
88
5
52
79
2
5
11
1.02
95348780--95348843
20
3.4
19
75
14
62
14
0
17
68
1.21
95348832--95348859
13
2.2
13
100
0
56
21
0
14
64
1.29
95348794--95348867
16
4.4
16
73
20
71
18
0
16
64
1.29
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95348791--95348859
36
1.9
35
88
8
104
17
0
14
68
1.22
95348852--95348909
26
2.3
26
88
8
86
37
5
8
48
1.56
95348860--95348917
26
2.2
26
81
6
64
36
5
13
44
1.66
95348878--95348969
39
2.4
37
81
15
107
32
3
13
51
1.57
95353290--95353343
18
3.0
18
77
0
54
11
27
37
24
1.89
95355552--95355603
26
2.0
26
84
0
68
25
1
3
69
1.16
95355552--95355633
13
6.6
12
71
12
58
29
1
4
64
1.22
95355354--95355742
150
2.6
148
90
4
622
27
4
7
59
1.46
95355777--95355815
17
2.4
16
87
8
60
12
7
2
76
1.09
95356348--95356403
3
19.7
3
80
10
64
0
33
0
66
0.92
95356547--95356580
18
1.9
18
88
5
52
8
2
5
82
0.93
95361556--95361612
28
2.0
28
96
0
105
35
24
24
15
1.95
95365286--95365321
18
2.0
18
88
0
54
27
2
8
61
1.39
95370136--95370180
23
2.0
23
86
4
65
31
0
13
55
1.38
95373577--95373657
39
2.1
39
100
0
162
29
4
19
45
1.71
95375334--95375367
7
5.0
7
85
7
52
82
0
0
17
0.67
95375335--95375365
13
2.4
13
94
0
53
83
0
0
16
0.64
95376225--95376294
18
3.7
19
80
16
67
28
2
2
65
1.21
95376250--95376461
3
72.0
3
68
17
97
28
5
2
64
1.28
95376649--95376737
27
3.2
27
81
10
83
32
7
6
52
1.56
95376674--95376733
26
2.3
26
82
8
77
33
6
6
53
1.53
95384764--95384874
56
2.0
56
98
0
213
22
26
5
45
1.73
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
95388414--95388525
44
2.6
44
88
7
158
43
16
25
15
1.86
95389387--95390116
77
9.2
74
69
18
406
28
16
20
34
1.94
95389566--95390116
77
7.0
77
75
14
485
29
16
20
33
1.95
95389299--95389882
165
3.6
156
84
8
706
27
16
20
35
1.94
95389887--95390281
87
4.6
87
75
15
347
28
16
20
33
1.95
95389406--95390172
402
1.9
400
85
4
1069
28
16
20
34
1.94
95390099--95390132
16
2.1
16
88
0
50
17
8
2
70
1.25
95390024--95390357
87
3.8
89
75
10
267
29
15
19
35
1.93
95391357--95391398
14
2.9
14
80
19
50
83
2
0
14
0.75
95391357--95391399
21
2.0
22
90
4
70
81
2
0
16
0.79

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
          33   34   35   36   37   38   39   40   41   42   43   44   45   46   47   48   
          49   50   51   52   53   54   55   56   57   58   59   60   61   62   63   64   
          65   66   67   68   69   70   71   72   73   74   75   76   77   78   79   80   
          81   82   83   84   85   86   87   88   89   90   91   92   93   94   95   96   
          97   98   99   100   101   102   103   104   105   106   107   108   109   110   111   112   
          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
          177   178   179   180   181   182   183   184   185   186   187   188   189   190   191   192   
          193   194   195   196   197   198   199   200   201   202   203   204   205   206   207   208   
          209   210   211   212   213   214   215   216   217   218   219   220   221   222   223   224   
          225   226   227   228   229   230   231   232   233   234   235   236   237   238   239   240   
          241   242   243   244   245   246   247   248   249   250   251   252   253   254   255   256   
          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
          273   274   275   276   277   278   279   280   281   282   283   284   285   286   287   288   
          289   290   291   292   293   294   295   296   297   298   299   300   301   302   303   304   
          305   306   307   308   309   310   311   312   313   314   315   316   317   318   319   320   
          321   322   323   324   325   326   327   328   329   330   331   332   333   334   335   336   
          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362