Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  51  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15195054--15195089
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18
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13
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28
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2.0
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20
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2.0
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0
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2
1
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18
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0
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2.1
18
100
0
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18
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26
44
1.82
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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23
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2.0
21
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51
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26
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219
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20
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26
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2.0
32
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20
29
29
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20
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20
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2.2
20
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68
0
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2
1.01
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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1.78
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5
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31
1.18
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
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Entropy
(0-2)
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72
1.05
15412189--15412239
27
1.9
26
84
11
68
27
1
3
66
1.20
15415247--15415422
46
3.8
45
80
11
205
21
20
29
28
1.98
15415243--15415414
93
1.8
93
93
2
301
20
20
30
27
1.98
15420215--15420375
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2.4
65
82
7
180
33
16
26
22
1.96
15429711--15429736
7
3.7
7
100
0
52
42
0
0
57
0.98
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19
2.1
19
100
0
78
38
10
10
41
1.73
15445044--15445079
18
2.0
18
94
0
63
58
5
8
27
1.50
15446486--15446550
19
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19
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18
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43
1.66
15446480--15446550
35
2.0
35
100
0
142
36
19
2
40
1.67
15446898--15446940
21
2.2
19
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8
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37
16
0
46
1.47
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0
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0
0
40
0.97
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5
5.4
5
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0
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59
0
0
40
0.98
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50
2
1
46
1.20
15450742--15450772
16
1.9
16
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0
53
70
9
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12
1.31
15459947--15460006
30
2.0
30
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0
93
40
10
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31
1.84
15462846--15462890
17
2.6
17
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3
63
40
2
8
48
1.47
15465100--15465177
39
2.0
39
97
0
147
25
5
24
44
1.74
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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12
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0
50
44
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48
0
1.32
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28
3.0
29
77
11
93
53
2
2
42
1.27
15473020--15473165
70
2.1
70
100
0
292
21
19
10
48
1.79
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14
2.1
15
94
5
55
83
0
6
9
0.79
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27
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29
28
15
27
1.96
15478747--15478896
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1.8
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4
230
29
28
15
26
1.96
15486902--15487078
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6.6
27
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2
203
29
28
15
27
1.96
15486923--15487077
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1.9
81
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2
231
29
28
15
27
1.96
15488870--15489022
28
5.6
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3
189
28
28
15
26
1.96
15488870--15489021
55
2.7
55
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4
189
28
28
15
26
1.96
15495264--15495390
48
2.8
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8
141
35
22
14
26
1.94
15495283--15495413
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2.8
46
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2
181
33
22
16
28
1.95
15495914--15495952
21
1.9
19
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10
51
53
15
0
30
1.42
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2.3
40
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127
24
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1.97
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3.0
46
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0
193
24
31
9
34
1.88
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5.1
47
90
1
343
26
30
11
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1.91
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22
3.3
22
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29
57
26
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12
30
1.92
15507478--15507555
23
3.2
25
66
23
67
30
30
8
29
1.88
15511458--15511693
40
5.9
40
95
0
418
24
29
22
23
1.99
15513179--15513315
46
3.0
46
87
0
193
24
31
9
34
1.88
15513289--15513525
47
5.1
47
90
2
343
25
30
11
32
1.91
15513329--15513525
93
2.1
94
97
0
369
25
30
11
32
1.91
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
15516984--15517071
40
2.2
41
79
2
106
35
25
15
23
1.95
15518826--15518882
21
2.7
21
86
0
87
14
28
36
21
1.92
15522745--15522856
50
2.3
46
87
6
161
35
22
14
27
1.93
15523378--15523418
21
2.0
21
85
4
57
51
19
0
29
1.47
15530340--15530408
29
2.4
28
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20
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2
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49
1.25
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48
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48
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398
29
19
27
23
1.98
15533061--15533535
144
3.3
143
85
1
619
29
19
27
23
1.98
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14
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100
0
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0
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14
1.08
15547627--15547688
32
1.9
32
87
9
90
72
3
8
16
1.21

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
          17   18   19   20   21   22   23   24   25   26   27   28   29   30   31   32   
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          113   114   115   116   117   118   119   120   121   122   123   124   125   126   127   128   
          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
          145   146   147   148   149   150   151   152   153   154   155   156   157   158   159   160   
          161   162   163   164   165   166   167   168   169   170   171   172   173   174   175   176   
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          257   258   259   260   261   262   263   264   265   266   267   268   269   270   271   272   
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          337   338   339   340   341   342   343   344   345   346   347   348   349   350   351   352   
          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362