Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  243  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82129335--82129421
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42
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2.0
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1.9
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1.92
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2.1
18
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0
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16
8
32
1.77
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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104
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2.0
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21
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27
1.98
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2.4
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247
23
29
19
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1.98
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2.0
20
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0
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15
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1.85
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5.8
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100
0
70
48
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0
34
1.47
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2
2
32
1.22
82325076--82325152
28
2.7
28
74
22
70
62
2
2
32
1.23
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18
2.2
20
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35
2
0
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1.09
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1
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23
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1.98
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1.98
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3.4
9
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25
9
22
41
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82353910--82354044
54
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54
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1.95
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50
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1.99
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19
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56
36
5
13
44
1.68
82368359--82368412
27
2.0
27
85
0
72
38
7
14
38
1.75
82368660--82368900
99
2.5
97
84
6
317
26
19
26
28
1.98
82368660--82368900
97
2.4
99
83
5
303
26
19
26
28
1.98
82371152--82371187
18
1.9
19
88
5
56
36
5
13
44
1.68
82374219--82374272
27
2.0
27
85
0
72
38
7
14
38
1.75
82375891--82375998
44
2.4
44
84
3
135
30
22
13
33
1.93
82383253--82383360
44
2.4
44
85
3
144
29
22
13
34
1.93
82386369--82386412
21
2.0
21
83
12
54
11
13
15
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1.62
82388806--82388849
20
2.2
20
87
0
61
36
29
2
31
1.70
82388935--82389044
43
2.6
42
80
8
125
29
22
16
31
1.96
82400285--82400350
27
2.4
27
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5
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28
15
16
39
1.89
82403130--82403299
41
4.1
41
72
18
129
28
27
21
22
1.99
82409276--82409512
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4.7
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4
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11
18
37
1.87
82409274--82409508
100
2.3
100
85
2
303
31
11
19
37
1.87
82409319--82409533
50
4.3
50
83
2
236
31
11
17
40
1.84
82409319--82409530
100
2.1
100
85
3
275
32
11
16
40
1.84
82414873--82414993
43
2.9
42
80
9
149
23
19
27
29
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82416254--82416318
32
2.0
32
96
0
121
23
12
23
41
1.87
82417379--82417436
27
2.1
27
83
0
71
31
15
17
36
1.91
82419733--82419904
46
3.7
46
80
13
208
20
20
30
28
1.98
82419723--82419896
93
1.9
93
93
0
303
21
21
29
27
1.99
82422259--82422311
17
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18
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41
0
13
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1.43
82425811--82425862
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1.9
27
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0
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1.97
82430631--82430712
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20
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17
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25
1.97
82436953--82437173
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4.8
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10
200
23
18
26
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1.97
82441082--82441211
29
4.5
29
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0
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1.94
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10
90
9
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38
0
0
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0.96
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19
2.1
19
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43
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30
1.77
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2.0
86
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0
343
31
16
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1.93
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18
1.9
17
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5
59
50
0
2
47
1.16
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3.0
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1.97
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33
2.0
33
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0
125
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23
8
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1.86
82487661--82487712
20
2.6
20
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0
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1.93
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110
2.0
109
92
0
368
30
15
16
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1.90
82499864--82499902
19
2.0
19
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5
51
20
17
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53
1.68
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2.0
49
100
0
194
35
17
14
32
1.90
82502127--82502178
18
2.9
17
77
11
50
48
5
30
15
1.68
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2.3
18
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0
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29
0
53
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1.44
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15
2.0
15
100
0
60
26
0
13
60
1.34
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
82502402--82502572
83
2.0
83
85
8
231
40
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5
45
1.59
82504366--82504399
18
2.0
18
88
11
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47
0
5
47
1.26
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19
28
26
1.99
82517835--82517873
17
2.2
18
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4
62
38
5
12
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1.65
82519071--82519243
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2.1
82
84
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222
46
5
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39
1.57
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2.7
20
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1
1
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1.04
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55
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26
26
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2.2
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21
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26
1.99
82537776--82537982
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3.8
54
77
1
200
20
23
17
38
1.93

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362