Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  345  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114625116--114625189
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2.2
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2.6
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1.50
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20
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0
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25
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29
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5.8
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2
245
27
26
18
27
1.98
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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6
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0
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2.0
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30
1.95
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2.1
84
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2
194
29
19
17
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2
22
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4.9
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6
216
26
16
24
32
1.96
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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24
32
1.96
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2.8
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105
39
15
8
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1.79
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72
39
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10
34
1.81
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2.1
12
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0
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1.91
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51
2
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24
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2
70
32
15
21
30
1.94
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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89
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29
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2.7
46
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2
162
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26
15
27
1.96
114787472--114787586
31
3.7
31
91
0
176
26
26
20
26
1.99
114787565--114787741
50
3.5
50
91
0
273
25
21
16
36
1.94
114791616--114791672
26
2.2
26
87
0
87
36
14
8
40
1.76
114802379--114802504
47
2.7
49
83
4
152
31
24
14
29
1.94
114802508--114802536
7
4.1
7
100
0
58
13
27
13
44
1.82
114802535--114802712
31
5.7
31
89
1
234
26
26
19
27
1.99
114802542--114802712
62
2.8
62
90
0
261
26
26
19
28
1.99
114802535--114802712
93
1.9
93
89
0
275
26
26
19
27
1.99
114802690--114802866
50
3.5
50
88
2
257
27
21
16
35
1.94
114805471--114805675
52
3.9
52
81
5
191
30
26
17
24
1.97
114805527--114805675
52
2.9
52
88
2
201
31
27
17
23
1.97
114806863--114806895
17
1.9
17
88
11
50
36
15
0
48
1.45
114808809--114808848
3
13.3
3
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0
71
32
2
0
65
1.06
114808948--114809072
3
43.0
3
66
12
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29
7
2
60
1.36
114809038--114809075
17
2.2
17
90
0
58
31
2
2
63
1.22
114809035--114809072
20
1.9
20
94
0
67
31
2
2
63
1.22
114809233--114809262
15
2.0
15
93
0
51
33
10
0
56
1.32
114813381--114813405
13
1.9
13
100
0
50
48
0
0
52
1.00
114824876--114824944
28
2.3
31
78
7
81
39
0
4
56
1.19
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114827986--114828353
126
2.9
126
92
1
587
27
17
16
38
1.91
114828429--114828476
22
2.2
22
88
3
71
50
18
0
31
1.48
114828462--114828515
22
2.5
22
78
0
63
37
14
1
46
1.56
114828582--114828623
22
1.9
22
100
0
84
40
16
0
42
1.48
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34
2.0
34
88
2
102
42
19
1
36
1.60
114828393--114828801
108
3.8
108
86
4
539
41
18
1
38
1.59
114828709--114828780
34
2.2
32
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5
99
38
18
2
40
1.65
114828582--114828787
56
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15
218
40
18
1
38
1.60
114828743--114828804
22
2.8
21
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13
70
40
17
1
40
1.60
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21
2.1
22
87
8
65
70
0
0
29
0.88
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5
10.8
5
76
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53
44
0
1
53
1.10
114840493--114840548
12
4.5
12
81
16
69
44
0
1
53
1.11
114841873--114841911
18
2.1
19
90
4
62
41
0
10
48
1.37
114842151--114842285
39
3.4
39
73
6
103
22
20
28
28
1.99
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19
2.2
19
87
12
59
46
0
24
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1.53
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30
2.1
30
100
0
124
37
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14
3.2
13
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15
54
68
0
0
31
0.89
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105
1.9
105
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253
26
23
14
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16
2.0
17
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11
50
43
3
0
53
1.16
114875139--114875177
20
1.9
21
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5
53
23
7
0
69
1.14
114889331--114889379
26
2.0
26
88
8
75
30
0
6
63
1.19
114890206--114890252
22
2.1
22
84
7
60
68
2
0
29
1.02
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
114890206--114890243
11
3.5
11
89
3
60
68
0
0
31
0.90
114890325--114890364
21
2.0
20
85
5
53
40
15
2
42
1.60
114898181--114898273
18
5.2
18
88
0
132
35
16
21
26
1.94
114898670--114898739
36
1.9
36
100
0
140
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25
35
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15
2.9
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2
2
66
1.15
114914215--114914269
22
2.4
22
84
9
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34
5
5
54
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114917717--114917754
18
2.1
19
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55
0
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128
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5
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1.79
114919779--114919849
16
4.4
16
85
0
106
29
28
5
36
1.80
114921091--114921137
7
6.6
7
79
13
51
53
0
2
44
1.12

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          129   130   131   132   133   134   135   136   137   138   139   140   141   142   143   144   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362