Tandem Repeats Finder Program written by:
Gary Benson
Program in Bioinformatics
Boston University
Version 4.09

Please cite:
G. Benson,
"Tandem repeats finder: a program to analyze DNA sequences"
Nucleic Acid Research(1999)
Vol. 27, No. 2, pp. 573-580.

Sequence: Gbar_A08
Parameters: 2 7 7 80 10 50 1000
Length:  119882356

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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This is table  74  of  362  ( 43380 repeats found )

Click on indices to view alignment
Table Explanation

Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23062488--23062643
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3
205
26
15
28
29
1.96
23070674--23070829
82
1.9
81
88
3
233
26
15
28
29
1.96
23070670--23070850
82
2.2
81
83
2
229
27
15
27
29
1.96
23093114--23093189
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22
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19
2.1
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5
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2.0
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2
173
19
13
28
38
1.90
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23159038--23159249
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4.6
46
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164
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29
18
28
1.98
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3.9
42
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145
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19
27
25
1.99
23165084--23165441
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18
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1.98
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2.0
138
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19
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1.99
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18
27
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1.98
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2.7
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197
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25
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0
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2.0
15
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1.70
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1.96
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20
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1.91
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2.1
30
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48
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1.52
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3.4
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34
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1.67
23234573--23234601
9
3.3
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0
0
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2.1
29
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1.30
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2.6
25
77
7
67
22
6
3
68
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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12
57
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147
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19
30
28
1.98
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93
1.9
93
91
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283
21
20
30
28
1.98
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19
2.1
19
100
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80
52
0
15
32
1.43
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39
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42
13
14
29
1.84
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23284076--23284107
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16
29
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100
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74
16
24
18
40
1.90
23287663--23287775
45
2.5
45
83
0
145
23
17
17
41
1.90
23291066--23291450
40
9.6
40
91
2
562
28
27
21
22
1.99
23299556--23299818
40
6.6
40
93
4
401
27
27
22
22
1.99
23299556--23299818
118
2.2
120
91
4
417
27
27
22
22
1.99
23304725--23304762
18
2.1
19
90
5
60
50
0
0
50
1.00
23315427--23315499
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2.0
36
100
0
146
46
24
2
26
1.66
23316356--23316489
42
3.2
42
98
0
259
25
34
20
20
1.96
23319279--23319339
26
2.4
26
94
5
108
32
19
3
44
1.67
23327803--23327830
14
2.0
14
100
0
56
64
7
0
28
1.20
23327794--23327865
36
2.0
36
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8
101
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8
0
27
1.23
23327843--23327876
12
2.8
12
100
0
68
70
8
0
20
1.13
23327843--23327894
21
2.3
21
83
9
59
71
9
0
19
1.13
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2.3
33
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66
9
0
24
1.21
23327941--23327973
15
2.1
16
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11
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69
0
0
30
0.88
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67
2.9
64
78
8
205
29
16
30
23
1.97
23348797--23348830
14
2.4
14
100
0
68
35
14
5
44
1.70
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14
2.1
14
100
0
60
40
0
6
53
1.27
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
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2.1
14
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0
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41
0
6
51
1.28
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64
2.6
64
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0
285
46
5
7
40
1.54
23349493--23349701
114
1.8
113
91
1
346
46
7
7
38
1.59
23349612--23349640
14
2.1
14
100
0
58
41
0
6
51
1.28
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27
2.4
27
91
0
101
23
29
25
21
1.99
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25
2.6
25
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0
87
37
12
18
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1.87
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40
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5
215
27
26
22
22
1.99
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17
2.2
18
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4
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10
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1.74
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2.0
41
100
0
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19
14
9
56
1.66
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2.1
41
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4
133
19
19
6
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1.66
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1.9
33
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28
9
21
40
1.84
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2.3
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22
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16
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1.96
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2.4
43
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120
25
14
25
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1.94
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32
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14
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1.93
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48
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24
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46
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0
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25
29
8
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1.86
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47
7.1
47
93
0
544
25
27
12
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1.92
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40
6.9
40
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0
383
25
30
22
21
1.99
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80
3.5
80
92
0
467
26
30
21
21
1.99
23436601--23436778
46
3.9
46
93
0
266
25
30
8
35
1.85
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22
11.3
21
63
24
68
26
28
12
32
1.92
Indices
Period
Size
Copy
Number
Consensus
Size
Percent
Matches
Percent
Indels
Score
A
C
G
T
Entropy
(0-2)
23436803--23437089
47
6.1
47
94
0
475
26
28
11
33
1.92
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24
5.2
25
60
24
63
30
28
10
30
1.90
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40
6.9
40
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0
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25
30
22
20
1.98
23440579--23440861
80
3.5
80
93
0
476
26
30
21
21
1.98
23442328--23442505
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3.9
46
93
0
275
25
30
8
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1.86
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22
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21
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28
13
32
1.93
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7.0
47
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0
572
25
28
12
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1.93
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5.2
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28
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1.91
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2.4
96
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5
316
25
31
18
24
1.98
23449237--23449472
48
4.9
48
83
4
280
25
31
18
24
1.98

Tables:   1   2   3   4   5   6   7   8   9   10   11   12   13   14   15   16   
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          353   354   355   356   357   358   359   360   361   362